bash - Bash脚本，它允许TORQUE中的qsub等待作业完成，非常类似于SGE系统中的-sync y

我用的是带扭矩/最大转矩系统的集群。我有一个bash脚本，它使用qsub命令提交一个作业，然后执行一些操作，比如移动文件、编写ASCII文件和检查我提交的作业的输出。关于此输出，基本上，如果它包含数字1，则需要再次提交作业。如果与1不同，bash脚本将执行其他操作。
问题是qsub是在后台运行的，所有bash都是一次计算的。我想强迫qsub表现得像awk，cat，sort等等。。。当脚本在这些命令完成后继续运行时-如果不是放在后台。
所以，我需要bash在第一个qsub处停止，并在qsub完成后继续运行，这意味着，当作业完成时。有办法吗？它将类似于：

   -sync y    # in the SGE system, for instance.

我所拥有的：

#!/bin/bash
.
.
some commands
.
.
qsub my_application  # need to wait until my_application get done
.
.
more commands
.
.
my_application_output=(`cat my_application_output.txt`)

case "$my_application_output" in
["1"])
     qsub my_application
     ;;
["0"])
     some commands
     ;;
["100"])
     some commands
     ;;
*)
     some commands
     exit 1

esac

.
.

一些评论
不方便使用：qsub-I-x，一旦我想保留输出文件上的输出；并且不想通过启动交互模式（-I）锁定节点
我想这不是一个简单的工作依赖问题，一旦重新提交1）可能发生，2）可能不会，而且，最重要的是，如果发生（1），可能会多次。
谢谢大家

最佳答案

10月3日下午4:05：“这不是一个简单的工作依赖问题”
您必须创建一个简单的作业依赖性问题——无论如何，简单到足以让脚本处理。事实上，你的脚本可以打开my_application_output.txt，所以为什么不直接打开sleep？有点像

#!/usr/bin/env bash
# I prefer to have constants at the top
my_application_output_fp='/path/to/my_application_output.txt'
#
#
# some commands
#
#
qsub my_application
#
#
# more commands
#
#

# sleep until my_application outputs
while [[ ! -r "${my_application_output_fp}" ]] ; do
    sleep 1
done

my_application_output="$(cat ${my_application_output_fp})"
# process it

如果my_application_output.txt在my_application结尾结束之前写得太长，请更改my_application在退出之前写一个标志文件，然后在该门上打开：

#!/usr/bin/env bash
my_application_flag_fp='/path/to/my_application_flag.txt'
my_application_output_fp='/path/to/my_application_output.txt'
#
#
# some commands
#
#
qsub my_application
#
#
# more commands
#
#

# sleep until my_application writes flag
while [[ ! -r "${my_application_flag_fp}" ]] ; do
    sleep 1
done

if [[ ! -r "${my_application_output_fp}" ]] ; then
    # handle error
fi
# else
my_application_output="$(cat ${my_application_output_fp})"
# process it