关于装饰器,我有三个问题,但我找不到以下答案:

Q1)PyMC中装饰器的参数(@ Deterministic,@ Stochastic)表示什么?

Q2)

@pymc.stochastic(dtype=int)
def switchpoint(value=10, t_l=0, t_h=110):
    def logp(value, t_l, t_h):
        if value > t_h or value < t_l:
            return -np.inf
        else:
            return -np.log(t_h - t_l + 1)
    def random(t_l, t_h):
        from numpy.random import random
        return np.round( (t_l - t_h) * random() ) + t_l


1)print switchpoint.logp#按预期方式打印日志概率

2)打印switchpoint.random#不生成随机数

3)print switchpoint.random()#生成一个随机数

4)打印switchpoint.logp()#错误

如果2个无效,而3个有效,则1个无效,而稳定的4个有效(这与我观察到的相反)。有人可以解释发生了什么吗?

Q3)

@pymc.stochastic(dtype=int)
def switchpoint(value=1900, t_l=1851, t_h=1962):
    if value > t_h or value < t_l:
        # Invalid values
        return -np.inf
    else:
        # Uniform log-likelihood
        return -np.log(t_h - t_l + 1)


在这里,如果我键入logp,则未指定它仍然是switchpoint.logp,这段代码是否被执行?

最佳答案

Q1)随机的所有参数的含义记录在here中。确定性的参数相同,外加记录在here中的其他参数。

Q2)行为上的差异是PyMC内部存在一些魔术,它们实际上执行了switchpoint.logp函数并将其转换为Python property,而switchpoint.random没有得到这种处理,而是保留为函数。

如果您对实际发生的事情感到好奇,请参考以下一些source

def get_logp(self):
    if self.verbose > 1:
        print '\t' + self.__name__ + ': log-probability accessed.'
    logp = self._logp.get()
    if self.verbose > 1:
        print '\t' + self.__name__ + ': Returning log-probability ', logp

    try:
        logp = float(logp)
    except:
        raise TypeError, self.__name__ + ': computed log-probability ' + str(logp) + ' cannot be cast to float'

    if logp != logp:
        raise ValueError, self.__name__ + ': computed log-probability is NaN'

    # Check if the value is smaller than a double precision infinity:
    if logp <= d_neg_inf:
        if self.verbose > 0:
            raise ZeroProbability, self.errmsg + ": %s" %self._parents.value
        else:
            raise ZeroProbability, self.errmsg

    return logp

def set_logp(self,value):
    raise AttributeError, 'Potential '+self.__name__+'\'s log-probability cannot be set.'

logp = property(fget = get_logp, fset=set_logp, doc="Self's log-probability value conditional on parents.")


还有一些其他内容,例如在logp函数期间变成了LazyFunction之类的东西,但这是基本思想。

Q3)stochastic装饰器中包含一些(更多)魔术,它们使用代码自省功能确定randomlogp子函数是否在switchpoint中定义。如果是,它将使用logp子功能来计算logp,否则,将仅使用switchpoint本身。那个的源代码是here

# This gets used by stochastic to check for long-format logp and random:
if probe:
    # Define global tracing function (I assume this is for debugging??)
    # No, it's to get out the logp and random functions, if they're in there.
    def probeFunc(frame, event, arg):
        if event == 'return':
            locals = frame.f_locals
            kwds.update(dict((k,locals.get(k)) for k in keys))
            sys.settrace(None)
        return probeFunc

    sys.settrace(probeFunc)

    # Get the functions logp and random (complete interface).
    # Disable special methods to prevent the formation of a hurricane of Deterministics
    cur_status = check_special_methods()
    disable_special_methods()
    try:
        __func__()
    except:
        if 'logp' in keys:
            kwds['logp']=__func__
        else:
            kwds['eval'] =__func__
    # Reenable special methods.
    if cur_status:
        enable_special_methods()

for key in keys:
    if not kwds.has_key(key):
        kwds[key] = None

for key in ['logp', 'eval']:
    if key in keys:
        if kwds[key] is None:
            kwds[key] = __func__


同样,还有更多的事情要进行,而且相当复杂,但这是基本思想。

10-05 19:06