我有一个带有身份证号码和一堆代表基因树的模式的文件
前任：
021557 (sfra,(pdep,snud),((spal,sint),(sdro,(hpul,(sprp,afra)))));
005852 (snud,sfra,(pdep,(hpul,((afra,sprp),(sint,(spal,sdro))))));
023685 (sfra,snud,(pdep,(hpul,((sprp,(afra,spal)),(sdro,sint)))));
022020 (sfra,snud,(pdep,(hpul,(afra,(sprp,(sdro,(sint,spal)))))));
028284 (sfra,snud,(pdep,(hpul,(sprp,((sdro,sint),(spal,afra))))));
我对某个姐妹分类单元分组（spal，afra）感兴趣。如果树包含（spal，afra），我想从另一列打印id。
如果仅在上面的数据上运行，则输出应为：
023685号
028284号
我要做的是：
awk '{if ($2 == "(spal,afra)") { print $1 } }'
但我意识到，我要匹配的部分是在一堆其他字符内，而且在任何可预测的位置…
所以我需要寻找
任意数量的小写字母或括号或逗号
（西班牙，非洲）
任何数量的小写字母或括号或逗号或；
另外，我想我想知道发生在另一个顺序（afra，spal）。但是我要运行单独的匹配，组合输出，如果我记得对的话，用sort和uniq-c做一些事情……我以后可能会自己想出来的。
我对这个有点陌生，我已经花了几个小时想办法解决问题。谢谢您！
最佳答案
你好像把它作为输入文件
$ cat file
021557 (sfra,(pdep,snud),((spal,sint),(sdro,(hpul,(sprp,afra)))));
005852 (snud,sfra,(pdep,(hpul,((afra,sprp),(sint,(spal,sdro))))));
023685 (sfra,snud,(pdep,(hpul,((sprp,(afra,spal)),(sdro,sint)))));
022020 (sfra,snud,(pdep,(hpul,(afra,(sprp,(sdro,(sint,spal)))))));
028284 (sfra,snud,(pdep,(hpul,(sprp,((sdro,sint),(spal,afra))))));
用锥子
要打印包含
(spal,afra)的任何行的第一列：$ awk '/[(]spal,afra[)]/{print $1}' file
028284
条件
/[(]spal,afra[)]/选择包含(spal,afra)的行，并在这些行上打印第一个字段。在awk正则表达式中，paren是活动字符。因为我们想匹配字面上的paren，所以我们把它们放在方括号中，比如
print $1和[(]。使用sed
$ sed -n '/(spal,afra)/ s/\t.*//p' file
028284
[)]不会打印任何内容，除非我们明确要求。sed -n选择包含/(spal,afra)/的行。(spal,afra)删除第一个选项卡后的所有内容，然后打印剩余内容。默认情况下，sed使用基本正则表达式。这意味着
s/\t.*//p和(不活动。因此，我们不需要逃避他们。使用grep和cut
$ grep '(spal,afra)' file | cut -f1
028284
)选择包含grep '(spal,afra)' file的行，并从这些行中选择第一个字段。与sed一样，grep默认使用基本正则表达式。这意味着
(spal,afra)和cut -f1都被视为文本字符，不需要对它们进行转义。备选方案：查找
(或)如果我们想在
(spal,afra)之外查找(afra,spal)，则需要更新正则表达式。以awk为例：awk '/[(](spal,afra|afra,spal)[)]/{print $1}' file2
023685
028284
在这里，垂直条
(afra,spal)分隔选项。regex接受酒吧之前或之后的内容。