我有两个变量的散点图,例如:
x<-c(0.108,0.111,0.113,0.116,0.118,0.121,0.123,0.126,0.128,0.131,0.133,0.136)
y<-c(-6.908,-6.620,-5.681,-5.165,-4.690,-4.646,-3.979,-3.755,-3.564,-3.558,-3.272,-3.073)
我想找到更适合这两个变量之间关系的函数。
准确地说,我想比较三个模型的拟合:
linear
、 exponential
和 logarithmic
。我正在考虑将每个函数拟合到我的值,计算每种情况下的可能性并比较 AIC 值。
但我真的不知道如何或从哪里开始。对此的任何可能的帮助将不胜感激。
非常感谢您提前。
蒂娜。
最佳答案
这是比较五个模型的示例。由于前两个模型的形式,我们可以使用 lm
来获得良好的起始值。 (请注意,不应比较使用不同 y
变换的模型,因此我们不应将 lm1
和 lm2
用作比较模型,而应仅用于起始值。)现在为前两个中的每一个运行 nls
。在这两个模型之后,我们在 x
中尝试了不同次数的多项式。幸运的是 lm
和 nls
使用一致的 AIC
定义(尽管其他 R 模型拟合函数不一定具有一致的 AIC
定义),因此我们可以将 lm
用于多项式。最后,我们绘制前两个模型的数据和拟合。
AIC 越低越好,因此 nls1
最好跟在 lm3.2
之后,然后是 nls2
。
lm1 <- lm(1/y ~ x)
nls1 <- nls(y ~ 1/(a + b*x), start = setNames(coef(lm1), c("a", "b")))
AIC(nls1) # -2.390924
lm2 <- lm(1/y ~ log(x))
nls2 <- nls(y ~ 1/(a + b*log(x)), start = setNames(coef(lm2), c("a", "b")))
AIC(nls2) # -1.29101
lm3.1 <- lm(y ~ x)
AIC(lm3.1) # 13.43161
lm3.2 <- lm(y ~ poly(x, 2))
AIC(lm3.2) # -1.525982
lm3.3 <- lm(y ~ poly(x, 3))
AIC(lm3.3) # 0.1498972
plot(y ~ x)
lines(fitted(nls1) ~ x, lty = 1) # solid line
lines(fitted(nls2) ~ x, lty = 2) # dashed line
添加了更多模型,随后修复了它们并更改了符号。另外为了跟进 Ben Bolker 的评论,我们可以用 AICcmodavg 包中的
AIC
替换上面所有的 AICc
。关于r - 如何估计R中散点图的最佳拟合函数?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/15042435/