我有一个很大的fastq文件，我想将序列“ TTAAGG”添加到文件中每个序列的末尾（第2行，然后是第4行），同时仍保持fastq文件格式。例如：
这是我开始的第一行：
@HWI-D00449:41:C2H8BACXX:5:1101:1219:2053 1:N:0:
GCAATATCCTTCAACTA
+
FFFHFHGFHAGGIIIII
我希望它打印出来：
@HWI-D00449:41:C2H8BACXX:5:1101:1219:2053 1:N:0:
GCAATATCCTTCAACTATTAAGG
+
FFFHFHGFHAGGIIIII
我想用sed或awk可以解决这个问题，但是我找不到能够保留fastq格式的解决方案。
我试过了：
awk 'NR%4==2 { print $0 "TTAAGG"}' < file_in.fastq > fileout_fastq
这将TTAAGG添加到第二行，然后添加到第四行，但是它也删除了其他三行。
有没有人对我可以使用的命令行有建议，或者如果您知道当前可用的可以执行此操作的软件包，请告诉我！
最佳答案
尝试使用GNU sed：
sed '2~4s/$/TTAAGG/' file