python - rpy2 (version 2.3.10) - 从 R 包导入数据到 python

所以我试图将一些数据从 R 包导入 python 以测试我编写的其他一些 python-rpy2 函数。特别是，我在 R 中使用 SpatialEpi 包和 pennLC 数据集。

所以我能够导入 rpy2 包并正确连接到该包。但是，我不确定如何访问包中的数据。

import rpy2.robjects as robjects
from rpy2.robjects.packages import importr
spep = importr("SpatialEpi")

但是，我似乎无法访问 pennLC 包中的数据对象 SpatialEpi 来测试该功能。等效的 R 命令是:

data(pennLC)

有什么建议么。

最佳答案

在 R 中，执行 data("foo") 可以在工作区中创建任意数量的对象。在 rpy2 中，事物包含在环境中。这使它更干净。

from rpy2.robjects.packages import importr, data
spep = importr("SpatialEpi")
pennLC_data = data(spep).fetch('pennLC')

pennLC_data 是一个 Environment(将其视为命名空间)。

列出获取的内容:

pennLC_data.keys()

要获取所需的数据对象:

pennLC_data['pennLC'] # guessing here, it might be a different name

关于python - rpy2 (version 2.3.10) - 从 R 包导入数据到 python，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/23326651/