c - 在Mac OS X上将GNU科学库链接到R

我在一个用C编写的程序上工作了一段时间，这个程序使用GSL中的函数运行MCMC。我读过很多GNU文档和编写R扩展，也读过很多关于使用RcppGSL的内容，但在我看来，用C编写然后将函数动态加载到R中似乎更容易些。我看到了许多描述如何在Windows上构建函数的源代码，但我看到的关于如何在基于Unix的系统上使用它的所有内容都是“相对直截了当”和“简单”，但我不能让它工作。
我渴望有人来工作的C脚本是一个简单的脚本。简单地说，取一个具有给定行数和列数的数组，将其转换成一个gsl_矩阵，然后将其转换回一个数组（这基本上就是我的程序所做的，除了更改条目的全部内容之外）。C脚本是

#include <R.h>
#include <stdio.h>
#include <gsl/gsl_linalg.h>

void simple( int *n, int *rows, int *cols)
{
  int r,c;
  int Cols = *cols; //This step, and the step below it are unnecessary except for readability
  int Rows = *rows;
  gsl_matrix * m = gsl_matrix_alloc (Rows, Cols); // Declares a gsl_matrix m of size Rows x Cols

  for( r = 0; r< Rows; r++)
    for (c=0; c< Cols; c++)
      gsl_matrix_set(m,r,c, *(n+sizeof(int)*(Cols*r+c))); // The array is organized by rows, sets matrix values

  for( r=0; r< Rows; r++)
    for (c=0; c < Cols; c++)
      *(n+sizeof(int)*(Cols*r+c))=gsl_matrix_get(m,r,c); // This return matrix values to the array (should be the same as before)
}

我所做的是确保我的终端（MacOSX）和R共享simple.c保存到的同一目录。我编译了上面的类型

R CMD SHLIB simple.c

进入我的终端创建相应的simple.so文件，也保存到桌面。那么在R里我可以

dyn.load("simple.so")

这就是我收到错误的地方

Symbol not found: _gsl_matrix_alloc
Expected in: flat namespace

我对这个错误感到困惑，因为编译器似乎可以识别make文件< gsl/gsl_linalg.h >，所以我认为它不能识别函数的原因是R没有连接到库，但是我不知道如何解决这个问题。
在这一点上，如果函数都是可识别的，那么我可以在R中执行函数

x=.C("simple", c(as.integer(c(1,4,7,2,5,8,3,6,9)),as.integer(3),as.integer(3)))

如果我的函数动态加载正确，它就可以工作了，我将返回X，这正是我作为.C的第二个输入所输入的内容
任何洞察都将非常有帮助，无论是否有人成功地将GSL库链接到Mac OS X上的R，都可以给我发消息或发表评论。我在帮助论坛上唯一能找到的就是它是“简单的”或者“相对简单的”，但是我不知道该怎么做！请帮忙！

最佳答案

您需要指定gsl函数的位置：

R CMD SHLIB simple.c -lgsl -lgslcblas

关于c - 在Mac OS X上将GNU科学库链接到R，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/11554840/