来自scipy.integrate的quad需要参数func,a,b。其中func是要积分的函数,而a和b分别是积分下限和上限。 a和b必须是数字。
我遇到一种情况,我需要评估成千上万个不同a,b的函数积分并求和。这需要很长时间才能遍历。我试图只给a和b提供四元组数组,希望四元组会返回相应的数组,但这没有用。
这是一个代码,它说明了我正在尝试做的事情,既可以使用Python循环,但速度很慢,而且我对向量化的尝试也不起作用。关于如何解决此问题的任何建议都可以快速解决(numpy-is)?
import numpy as np
from scipy.integrate import quad
# The function I need to integrate:
def f(x):
return np.exp(-x*x)
# The large lists of different limits:
a_list = np.linspace(1, 100, 1e5)
b_list = np.linspace(2, 200, 1e5)
# Slow loop:
total_slow = 0 # Sum of all the integrals.
for a, b in zip(a_list, b_list):
total_slow += quad(f, a, b)[0]
# (quad returns a tuple where the first index is the result,
# therefore the [0])
# Vectorized approach (which doesn't work):
total_fast = np.sum(quad(f, a_list, b_list)[0])
"""This error is returned:
line 329, in _quad
if (b != Inf and a != -Inf):
ValueError: The truth value of an array with more than
one element is ambiguous. Use a.any() or a.all()
"""
编辑:
我需要集成的实际功能(
rho
)还包含其他两个因素。 rho0
是长度与a_list
和b_list
相同的数组。 H
是标量。def rho(x, rho0, H):
return rho0 * np.exp(- x*x / (2*H*H))
编辑2:
分析不同的解决方案。 “ space_sylinder”是积分发生的函数。 Warren Weckesser的建议与通过简单的分析函数传递数组一样快,并且比慢速Python循环快约500倍(请注意,该程序甚至没有完成,并且仍使用657秒的调用次数)。
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
# Analytic (but wrong) approximation to the solution of the integral:
108 1.850 0.017 2.583 0.024 DensityMap.py:473(space_sylinder)
# Slow python loop using scipy.integrate.quad:
69 19.223 0.279 657.647 9.531 DensityMap.py:474(space_sylinder)
# Vectorized scipy.special.erf (Warren Weckesser's suggestion):
108 1.786 0.017 2.517 0.023 DensityMap.py:475(space_sylinder)
最佳答案
exp(-x*x)
的积分是error function的缩放版本,因此您可以使用scipy.special.erf
计算积分。给定标量a
和b
,从a
到b
的函数积分为0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b) - erf(a))
。erf
是"ufunc",表示它处理数组参数。给定a_list
和b_list
,您的计算可以写为
total = 0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b_list) - erf(a_list)).sum()
通过使用适当的缩放比例,也可以使用
rho
处理函数erf
:g = np.sqrt(2)*H
total = g*rho0*0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b_list/g) - erf(a_list/g)).sum()
在依靠它之前,请对照您的慢速解决方案进行检查。对于某些值,
erf
函数的减法会导致精度显着下降。关于python - 极限数组上的scipy.integrate.quad,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/29035107/