来自scipy.integrate的quad需要参数func,a,b。其中func是要积分的函数,而a和b分别是积分下限和上限。 a和b必须是数字。

我遇到一种情况,我需要评估成千上万个不同a,b的函数积分并求和。这需要很长时间才能遍历。我试图只给a和b提供四元组数组,希望四元组会返回相应的数组,但这没有用。

这是一个代码,它说明了我正在尝试做的事情,既可以使用Python循环,但速度很慢,而且我对向量化的尝试也不起作用。关于如何解决此问题的任何建议都可以快速解决(numpy-is)?

import numpy as np
from scipy.integrate import quad

# The function I need to integrate:
def f(x):
    return np.exp(-x*x)

# The large lists of different limits:
a_list = np.linspace(1, 100, 1e5)
b_list = np.linspace(2, 200, 1e5)

# Slow loop:
total_slow = 0  # Sum of all the integrals.
for a, b in zip(a_list, b_list):
    total_slow += quad(f, a, b)[0]
        # (quad returns a tuple where the first index is the result,
        # therefore the [0])

# Vectorized approach (which doesn't work):
total_fast = np.sum(quad(f, a_list, b_list)[0])

"""This error is returned:

 line 329, in _quad
    if (b != Inf and a != -Inf):
ValueError: The truth value of an array with more than
one element is ambiguous. Use a.any() or a.all()
"""


编辑:

我需要集成的实际功能(rho)还包含其他两个因素。 rho0是长度与a_listb_list相同的数组。 H是标量。

def rho(x, rho0, H):
    return rho0 * np.exp(- x*x / (2*H*H))


编辑2:

分析不同的解决方案。 “ space_sylinder”是积分发生的函数。 Warren Weckesser的建议与通过简单的分析函数传递数组一样快,并且比慢速Python循环快约500倍(请注意,该程序甚至没有完成,并且仍使用657秒的调用次数)。

   ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
# Analytic (but wrong) approximation to the solution of the integral:
      108    1.850    0.017    2.583    0.024 DensityMap.py:473(space_sylinder)
# Slow python loop using scipy.integrate.quad:
       69   19.223    0.279  657.647    9.531 DensityMap.py:474(space_sylinder)
# Vectorized scipy.special.erf (Warren Weckesser's suggestion):
      108    1.786    0.017    2.517    0.023 DensityMap.py:475(space_sylinder)

最佳答案

exp(-x*x)的积分是error function的缩放版本,因此您可以使用scipy.special.erf计算积分。给定标量ab,从ab的函数积分为0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b) - erf(a))

erf"ufunc",表示它处理数组参数。给定a_listb_list,您的计算可以写为

total = 0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b_list) - erf(a_list)).sum()


通过使用适当的缩放比例,也可以使用rho处理函数erf

g = np.sqrt(2)*H
total = g*rho0*0.5*np.sqrt(np.pi)*(erf(b_list/g) - erf(a_list/g)).sum()


在依靠它之前,请对照您的慢速解决方案进行检查。对于某些值,erf函数的减法会导致精度显着下降。

关于python - 极限数组上的scipy.integrate.quad,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/29035107/

10-10 04:18