linux - 简单的awk命令问题(与FS，OFS有关)

我试图重新整理包含以下内容的文件的格式:

>Humanl|chr16:86430087-86430726 | element 1 | positive
>Humanl|chr16:85620095-85621736 | element 2 | negative
>Humanl|chr16:80423343-80424652 | element 3 | negative
>Humanl|chr16:80372593-80373755 | element 4 | positive
>Humanl|chr16:79969907-79971297 | element 5 | negative
>Humanl|chr16:79949950-79951518 | element 6 | negative
>Humanl|chr16:79026563-79028162 | element 7 | negative
>Humanl|chr16:78933253-78934686 | element 9 | negative
>Humanl|chr16:78832182-78833595 | element 10 | negative

我的命令是:

awk '{FS="|";OFS="\t"} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

这是输出:

>Human|chr16:86430087-86430726  |      element 1      |
>Human  chr16:85620095-85621736         element 2      negative
>Human  chr16:80423343-80424652         element 3      negative
>Human  chr16:80372593-80373755         element 4      positive
>Human  chr16:79969907-79971297         element 5      negative
>Human  chr16:79949950-79951518         element 6      negative
>Human  chr16:79026563-79028162         element 7      negative
>Human  chr16:78933253-78934686         element 9      negative
>Human  chr16:78832182-78833595         element 10     negative

除第一行外，每一行都工作正常。我不明白为什么会这样。

有人可以帮我吗？谢谢!

最佳答案

简短答案

设置FS和OFS太晚而影响第一行，请改用以下方法:

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

您也可以使用以下较短的版本:

awk -v FS='|' -v OFS='\t' '$1=$1'

答案更长一点

这是行不通的，因为在设置FS和OFS时，awk已经执行了记录/字段拆分。您可以通过将$0设置为$0来强制重新拆分，例如:

awk '{FS="|";OFS="\t";$0=$0} {print $1,$2,$3,$4,$5}'

做到这一点的常规方法是:1.在FS子句中设置BEGIN和其他代码； 2.通过-v VAR=VALUE表示法设置它们；或3.在脚本后将它们追加为VAR=VALUE。我首选的样式是最后一个选择:

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5}' FS='|' OFS='\t'

请注意，设置-v和后脚本变量之间存在显着差异。 -v将在BEGIN子句之前设置变量，而后脚本设置将在BEGIN子句之后设置变量。