我无法让输入滑块在 Shiny 的应用程序中呈现在 ggvis 图中。绘图在没有输入滑块的情况下渲染良好，但在添加 Shiny 后会引发此错误:
Listening on http://xxxxxxxxxxxxxx
Error in eval(expr, envir, enclos) : could not find function "compdat" 服务器.R:
library(shiny)
library(ggvis)
data<-data.frame(var1=rnorm(30,5,2.3),var2=rbeta(30,1.5,.8),var3=rnorm(30,10,2.5))
shinyServer(function(input, output,session) {
compdat<-reactive({data[, c(input$xInp,input$yInp)]})
vis1 <-reactive({
compdat %>% ggvis(x= ~compdat()[,1],y= ~compdat()[,2]) %>%
layer_points(fill:="red") %>% layer_smooths(span=input_slider(.1,1,id="scores_ui"))
})
vis1 %>% bind_shiny("scores",controls_id="scores_ui")
vis2<-reactive({
compdat %>% ggvis(x= ~compdat()[,1],y= ~compdat()[,2]) %>%
layer_points(fill:="red") %>% ayer_smooths(span=input_slider(.1,1,id="loadings_ui"))
})
vis2 %>% bind_shiny("loadings",controls_id="loadings_ui")
})用户界面:
shinyUI(fluidPage(
title="PCA Explorer",
h2("Principal Component Explorer"),
fluidRow(
column(6,ggvisOutput("scores"),
uiOutput("scores_ui")),
column(6,ggvisOutput("loadings"),
uiOutput("loadings_ui"))
),
br(),
fluidRow(
column(6,h3("Component Selection"),selectInput('xInp',"X Variable",names(data)),
selectInput('yInp',"Y Variable",names(data),selected=names(data)[[2]])),
column(6,h3("Summary of Selected Data Points"),verbatimTextOutput("diagn"))
)
))关于如何让滑块渲染的任何见解都会很棒。我花了相当多的时间来挖掘这个问题。提前致谢
最佳答案
在此 Movie Explorer example 中可以找到一个很好的示例，演示如何使用 selectizeInput 自定义 X/Y 轴变量。
但是，将 ggvis() 函数包装在响应式(Reactive)环境中具有突出的缺点(或错误)，即一旦您更改 input$xInp$ 或 input$yInp ， layer_smooths() 就会停止对您的滑块输入使用react。
您的代码的另一个潜在问题是 data 对 ui.R 不可见。
您可能想要创建一个包含 global.R 对象的 data 文件。
下面我将介绍如何通过选择 X/Y 变量与 ggvis 图进行交互的两种方法。您可以在 server.R 中找到它们。
全局R
data <- data.frame(var1=rnorm(30,5,2.3),
var2=rbeta(30,1.5,.8),
var3=rnorm(30,10,2.5))
用户界面
library(shiny)
shinyUI(fluidPage(
title="PCA Explorer",
h2("Principal Component Explorer"),
fluidRow(
column(6,
ggvisOutput("scores"),
uiOutput("scores_ui")),
column(6,
ggvisOutput("loadings"),
uiOutput("loadings_ui"))
),
br(),
fluidRow(
column(6,
h3("Component Selection"),
selectInput('xInp',"X Variable", choices=names(data),
selected=names(data)[[1]]),
selectInput('yInp',"Y Variable", choices=names(data),
selected=names(data)[[2]])
),
column(6,
h3("Summary of Selected Data Points"),
verbatimTextOutput("diagn"))
)
))
服务器
library(shiny)
library(ggvis)
shinyServer(function(input, output,session) {
# Approach 1: regenerate a compdat object once the input changes
# rename the X/Y variables to fixed names.
compdat <- reactive({
x <- data[, c(input$xInp, input$yInp)]
names(x) <- c("x", "y")
x
})
# NOTE that you use compdat here instead of compdat()
compdat %>% ggvis(x=~x, y=~y) %>%
layer_points(fill:="red") %>%
layer_smooths(span=input_slider(.1,1)) %>%
bind_shiny("scores", controls_id="scores_ui")
# Approach 2: wrap ggvis in a reactive environment
# This however, would stop to react to slider input
# once input$xInp or input$yInp changes.
vis2 <- reactive({
xvar <- prop("x", as.symbol(input$xInp))
yvar <- prop("y", as.symbol(input$yInp))
data %>% ggvis(x=xvar, y=yvar) %>%
layer_points(fill:="red") %>%
layer_smooths(span=input_slider(.1,1))
})
vis2 %>% bind_shiny("loadings", controls_id="loadings_ui")
})
这两种方法都应该有效(好吧，几乎)。但是等等，您可能会看到平滑层在您更改 X/Y 变量后停止响应您的滑块更改。
要解决此问题，请考虑以下解决方案。
使用方法 2 解决问题
我之前提到的错误可以通过在
sliderInput 中创建一个 ui.R 来修复。用户界面
library(shiny)
shinyUI(fluidPage(
title="PCA Explorer",
h2("Principal Component Explorer"),
fluidRow(
column(6,
ggvisOutput("scores"),
uiOutput("scores_ui")
),
column(6,
ggvisOutput("loadings"),
uiOutput("loadings_ui"),
# Create a slider by Shiny, instead of by ggvis.
sliderInput('smooth_span',
h5("Smoothing span for plot 2"),
.1, 1, value=0.5)
)
),
br(),
fluidRow(
column(6,
h3("Component Selection"),
selectInput('xInp',"X Variable", choices=names(data),
selected=names(data)[[1]]),
selectInput('yInp',"Y Variable", choices=names(data),
selected=names(data)[[2]])
),
column(6,
h3("Summary of Selected Data Points"),
verbatimTextOutput("diagn"))
)
))
服务器
library(shiny)
library(ggvis)
shinyServer(function(input, output,session) {
# Approach 1: regenerate a compdat object once the input changes
# rename the X/Y variables to fixed names.
compdat <- reactive({
x <- data[, c(input$xInp, input$yInp)]
names(x) <- c("x", "y")
x
})
# NOTE that you use compdat here instead of compdat()
compdat %>% ggvis(x=~x, y=~y) %>%
layer_points(fill:="red") %>%
layer_smooths(span=input_slider(.1,1)) %>%
bind_shiny("scores", controls_id="scores_ui")
# Approach 2: wrap ggvis in a reactive environment
# This however, would stop to react to slider input
# once input$xInp or input$yInp changes.
vis2 <- reactive({
xvar <- prop("x", as.symbol(input$xInp))
yvar <- prop("y", as.symbol(input$yInp))
smooth.span <- input$smooth_span
data %>% ggvis(x=xvar, y=yvar) %>%
layer_points(fill:="red") %>%
# FIXED: use the value from the input object, instead of a input_slider
layer_smooths(span=smooth.span)
})
vis2 %>% bind_shiny("loadings", controls_id="loadings_ui")
})
最后的话
将
ggvis 包装到响应式环境中有一些缺点:但是，它确实有几个优点:
ggvis )，则将 input$xInp 包装在 react 环境中是目前 唯一的 方式。由于 ggvis 只计算一次数据并将数据绑定(bind)到 ggvis 对象，因此对轴标签所做的更改不会实时反射(reflect)。然而，因为在 react 环境中包装 ggvis 会导致整个图形重绘，所以标签也会在重绘中更新。 关于以 Shiny 的方式渲染 ggvis 控件，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/25088248/