perl - 提交网格作业时，如何控制使用的Perl版本？

我正在使用SGE(Sun Grid Engine)将作业提交到网格。我还使用perlbrew来管理已安装的Perl版本。
我编写了一些简短的sh脚本，用于运行需要特定Perl版本(5.12.2)的perl脚本，如下所示:

#!/bin/bash
#$-S /bin/bash

source /home/dave/.bash_profile
/home/dave/perl5/perlbrew/bin/perlbrew switch perl-5.12.2

/home/dave/scripts/proc_12.pl --in=/home/dave/in/in.store --dir=/home/dave/in/dir2 --params=/home/dave/in/params.p

现在，当我提交一项工作时，一切正常，但是当我提交许多工作时，我开始收到与perlbrew相关的错误消息，例如:

ln: creating symbolic link `current' to `perl-5.12.2': File exists
ln: creating symbolic link `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpan' to `/home/dave/perl5/perlbrew/perls/current/bin/cpan': File exists
ln: creating symbolic link `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpan2dist' to `/home/dave/perl5/perlbrew/perls/current/bin/cpan2dist': File exists
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/cpanp': No such file or directory
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/enc2xs': No such file or directory
ln: cannot remove `/home/dave/perl5/perlbrew/bin/find2perl': No such file or directory

所以我猜/home/dave/perl5/perlbrew/bin/perlbrew switch perl-5.12.2行引起了问题。

我能做什么？

如何使我的脚本使用perl-5.12.2(默认值为5.8.8)运行？

最佳答案

我不建议将perlbrew switch perl-5.12.2放在您运行的任何脚本中。它实际上仅用于命令行使用。

如果您需要一个脚本来使用特定版本的Perl，则可以在shebang上为其提供完整的perlbrew路径:

#!/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl

use 5.012;
use warnings;
...

然后确保其可执行文件并按以下方式运行:

chmod +x your_perl_program.pl
./your_perl_program.pl

或者，在脚本中使用perl二进制文件的完整路径名:

#!/bin/bash

/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl your_perl_program.pl

顺便说一句，如果您在脚本或perl程序中运行任何不合格的程序，则可能会产生生产和安全问题。例如:

#!/bin/sh

# security risk
perl some_script.pl

# and not just perl
tar cvf archive.tar *.txt

# production risk
/home/dave/perl5/perlbrew/bin/perl some_other_script.pl

前两个不好，因为它将拾取您在路径中找到的第一个perl和tar。因此，这取决于$PATH设置，这可能会带来安全风险。最后一个也不是很好，因为它依赖于在其运行的时间点当前切换到的perl perlbrew:

因此，这样做可能是潜在的生产和安全噩梦。相反，上面应该这样写:

#!/bin/sh

# fully qualified now.  Uses OS provided perl
/usr/bin/perl some_script.pl

# ditto
/usr/bin/tar cvf archive.tar *.txt

# this needs to run in perl 5.12.2
/home/dave/perl5/perlbrew/perls/perl-5.12.2/bin/perl some_other_script.pl

希望一切都说得通吗？