我正在阅读Abdi&Williams(2010)的“主成分分析”,我正在尝试重做SVD以获取进一步PCA的值。
本文指出,以下SVD:
X = P D Q ^ t
我将数据加载到np.array X中。
X = np.array(data)
P, D, Q = np.linalg.svd(X, full_matrices=False)
D = np.diag(D)
但是我检查时没有得到上述平等
X_a = np.dot(np.dot(P, D), Q.T)
X_a和X是相同的尺寸,但是值不相同。我是否缺少某些内容,或者np.linalg.svd函数的功能与本文的方程式不兼容?
最佳答案
TL; DR:numpy的SVD计算X = PDQ,因此Q已转位。
SVD有效地将矩阵X
分解为旋转P
和Q
以及对角矩阵D
。我拥有的linalg.svd()
版本返回P
和Q
的正向旋转。在计算Q
时,您不希望转换X_a
。
import numpy as np
X = np.random.normal(size=[20,18])
P, D, Q = np.linalg.svd(X, full_matrices=False)
X_a = np.matmul(np.matmul(P, np.diag(D)), Q)
print(np.std(X), np.std(X_a), np.std(X - X_a))
我得到:1.02、1.02、1.8e-15,表明
X_a
非常准确地重构了X
。如果您使用的是Python 3,则
@
运算符将实现矩阵乘法,并使代码易于遵循:import numpy as np
X = np.random.normal(size=[20,18])
P, D, Q = np.linalg.svd(X, full_matrices=False)
X_a = P @ diag(D) @ Q
print(np.std(X), np.std(X_a), np.std(X - X_a))
print('Is X close to X_a?', np.isclose(X, X_a).all())
关于python - 使用Numpy(np.linalg.svd)进行奇异值分解,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/24913232/