我的环境中有一个特定的错误,以至于我无法始终如一地将 Rmarkdown 文件编织为 HTML、Word 文档或 PDF。编织能力因文件类型而异。
错误是:
Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1
直到一周前,我才能在同一环境中编织到所有三种文件类型,所以这是一个相对较新的错误。我的环境的高级规范是:
作为编织能力不一致的一个例子,我在 RStudio 中创建了一个新的 .Rmd 文件,它创建了熟悉的
summary(cars)
和 plot(pressure)
等标准模板。我没有改变任何东西。我能够成功地将其编织为 HTML 一次,Word .docx 一次,然后我尝试编织为 PDF 并出现上述错误。然后我回去尝试编织到 HTML 和 Word 并收到错误,即使原始编织没有任何变化。这只是行为类型的一个例子。不同的文档表现不同。为了排除故障,我重新安装了 R 和 RStudio(我相信 pandoc 提供了 RStudio 安装,所以我也有效地重新安装了 pandoc)。重新安装没有帮助。我试过清除 Knitr 缓存。那也没有用。我浏览了 SO 和互联网,发现了一些与 Glasgow-Haskell 编译器相关的类似错误,但我不知道那是什么以及它是否是问题的根源。
这是引发错误的 .Rmd 文件的示例:
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title: "Untitled"
author: "Vypa"
date: "February 8, 2018"
output:
html_document: default
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```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
## R Markdown
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
```{r cars}
summary(cars)
```
## Including Plots
You can also embed plots, for example:
```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.
这是完整的控制台错误:
Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1
In addition: Warning message:
running command '"C:/Users/Vypa/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS tst.utf8.md --to html --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash --output tst.html --smart --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template "C:\Users\Vypa\Documents\R\R-3.4.3\library\rmarkdown\rmd\h\default.html" --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable "theme:bootstrap" --include-in-header "C:\Users\Vypa\AppData\Local\Temp\RtmpI9Gxsx\rmarkdown-str5db029544a23.html" --mathjax --variable "mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"' had status 1
Execution halted
任何帮助或想法将不胜感激。
最佳答案
最近在 Win10 上安装 R&RStudio 后遇到同样的问题。 Pandoc 问题出现在之前错误的 .rmd 文件的编辑和 knitr 上。
在安装最新的 RStudio 预览版后解决
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/preview/
关于rstudio - Rmarkdown 编织错误 : Fault/access violation in generated code,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/48690325/