尝试使用Cython的memoryview时遇到分段错误。这是我的代码:
def fock_build_init_with_inputs(tei_ints):
# set the number of orbitals
norb = tei_ints.shape[0]
# get memory view of TEIs
cdef double[:,:,:,::1] tei_memview = tei_ints
# get index pairs
prep_ipss_serial(norb, &tei_memview[0,0,0,0])
void prep_ipss_serial(const int n, const double * const tei) {
int p, q, r, s, np;
double maxval;
const double thresh = 1.0e-9;
// first we count the number of index pairs with above-threshold integrals
np = 0;
for (q = 0; q < n; q++)
for (p = q; p < n; p++) {
maxval = 0.0;
for (s = 0; s < n; s++)
for (r = s; r < n; r++) {
maxval = fmax( maxval, fabs( tei[ r + n*s + n*n*p + n*n*n*q ] ) );
}
if ( maxval > thresh )
np++;
}
ipss_np = np;
当我通过输入numpy.zeros([n,n,n,n])调用第一个函数来运行代码时,当n超过特定数字时会遇到分段错误(212)。有谁知道导致此问题的原因以及如何解决?
谢谢,
鲁宁
最佳答案
看起来像32位整数溢出-即213*213*213*213
大于最大32位整数。您应该使用64位整数作为索引(long
或更明确的int64_t
)。
为什么要将您的memoryview转换为指针?您将不会获得很大的速度,并且会丢失有关形状的任何信息(例如,假设所有尺寸都相同),并且可以让Cython为您处理多维索引。使tei
参数成为memoryview而不是指针会更好。
关于python - Cython Memoryview段故障,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/58162070/