我已经与OpenMPI进行了一些合作,并且当我需要proc排名时我没有得到预期的行为。
我有一个简单的C程序,应该打印每个proc的等级:
minimal.c:
#include <stdio.h>
#include "mpi.h"
int
main (int argc, char *argv[])
{
unsigned int procs;
unsigned int self;
MPI_Comm com;
/* MPI ini */
MPI_Init (&argc, &argv);
com = MPI_COMM_WORLD;
MPI_Comm_size (com, &procs);
MPI_Comm_rank (com, &self);
printf("My rank is %d\n", self);
/* MPI Finalize */
MPI_Finalize();
return 0;
}
我用它编译:
mpicc minimal.c -o minimal
现在,如果我在自己的计算机上运行以下命令:
mpirun -np 2 minimal
我得到以下跟踪:
$ mpirun -np 2 minimal
My rank is 0
My rank is 0
我发现这很令人不安。
因此,我继续挖掘mpirun手册,并最终使用-display-devel-map和-report-bindings打印了其他信息,这就是我得到的跟踪:
$ mpirun -np 2 -display-devel-map -report-bindings minimal
Data for JOB [53858,1] offset 0
Mapper requested: NULL Last mapper: round_robin Mapping policy: BYCORE Ranking policy: SLOT
Binding policy: CORE:IF-SUPPORTED Cpu set: NULL PPR: NULL Cpus-per-rank: 1
Num new daemons: 0 New daemon starting vpid INVALID
Num nodes: 1
Data for node: UX31A Launch id: -1 State: 2
Daemon: [[53858,0],0] Daemon launched: True
Num slots: 2 Slots in use: 2 Oversubscribed: FALSE
Num slots allocated: 2 Max slots: 0
Username on node: NULL
Num procs: 2 Next node_rank: 2
Data for proc: [[53858,1],0]
Pid: 0 Local rank: 0 Node rank: 0 App rank: 0
State: INITIALIZED App_context: 0
Locale: [BB/..]
Binding: [BB/..]
Data for proc: [[53858,1],1]
Pid: 0 Local rank: 1 Node rank: 1 App rank: 1
State: INITIALIZED App_context: 0
Locale: [../BB]
Binding: [../BB]
[UX31A:04861] MCW rank 1 bound to socket 0[core 1[hwt 0-1]]: [../BB]
[UX31A:04861] MCW rank 0 bound to socket 0[core 0[hwt 0-1]]: [BB/..]
My rank is 0
My rank is 0
这让我感到困惑。
我正在使用Ubuntu 16.04和apt仓库中的OpenMPI软件包。我的电脑是华硕UX31a。
如果有人能给我一些关于这里发生的事情的见解,我将不胜感激。
谢谢 !
最佳答案
我终于发现了发生了什么事,这要归功于Gilles Gouaillardet!
原来我安装了mpich
个库以及openmpi
个垃圾箱!
这是我所做的:
检查在我的二进制文件中使用了哪个库:$ ldd minimal ... libmpich.so.12 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libmpich.so.12 ...
$ dpkg -S /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libmpich.so.12 libmpich12:amd64: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libmpich.so.12.1.0
检查哪个软件包提供了我的mpicc
和mpirun
二进制文件:$ which mpirun /usr/bin/mpirun
$ dpkg -S mpirun openmpi-bin: /usr/bin/mpirun.openmpi ...
我删除了已安装的mpich
软件包sudo apt-get remove libmpich12 libmpich-dev
我安装了需要的openmpi
库sudo apt-get install libopenmpi-dev
完成后,我再次编译:
$ mpicc minimal.c -o minimal
$ mpirun -np 2 minimal
My rank is 0
My rank is 1
万岁!
关于c - OpenMPI-在不同进程上的排名相同,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/49261093/