从有关numpy operations on numpy arrays中的掩码数组的文档中:
numpy.ma模块带有大多数ufunc的特定实现。具有有效域的一元和二进制函数(例如对数或除法)每当输入被屏蔽或超出有效域时都返回被屏蔽的常量:例如:
ma.log([-1, 0, 1, 2])
masked_array(data = [-- -- 0.0 0.69314718056],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
我有一个问题,在计算时,我需要知道这些无效操作在哪里产生。具体来说,我想这样做:
ma.log([-1, 0, 1, 2])
masked_array(data = [np.nan -- 0.0 0.69314718056],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
冒着这个问题进行对话的风险,我的主要问题是:
有什么好办法可以使此
masked_array
的计算出的无效值(由fix_invalid
“固定”的那些值,如np.nan和np.inf)不转换为屏蔽值(并与之屏蔽)?我当前的解决方案是在
masked_array.data
上计算函数,然后使用原始掩码重新构造掩码数组。但是,我正在编写一个应用程序,将用户的任意函数映射到许多不同的数组上,其中一些被掩码,有些未被掩码,并且我希望避免仅针对掩码数组的特殊处理程序。此外,这些数组在MISSING,NaN和Inf之间具有重要的区别,因此我不能只使用带有np.nan
而不是masked
值的数组。另外,如果有人对为什么存在这种行为有任何看法,我想知道。在同一操作中具有此功能似乎很奇怪,因为对未屏蔽值的操作结果的有效性确实是用户的责任,用户可以选择使用
fix_invalid
函数“清理”。此外,如果有人对numpy缺失值的进度有所了解,请分享,因为最早的posts是2011年至2012年,那场辩论从未导致任何结果。
编辑:2017-10-30
增加hpaulj的答案;具有修改域的log函数的定义会对numpy名称空间中的日志行为产生副作用。
In [1]: import numpy as np
In [2]: np.log(np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0]))
/home/salotz/anaconda3/bin/ipython:1: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log
#!/home/salotz/anaconda3/bin/python
/home/salotz/anaconda3/bin/ipython:1: RuntimeWarning: invalid value encountered in log
#!/home/salotz/anaconda3/bin/python
Out[2]:
masked_array(data = [-- -- 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
In [3]: mylog = np.ma.core._MaskedUnaryOperation(np.core.umath.log)
In [4]: np.log(np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0]))
/home/salotz/anaconda3/bin/ipython:1: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log
#!/home/salotz/anaconda3/bin/python
/home/salotz/anaconda3/bin/ipython:1: RuntimeWarning: invalid value encountered in log
#!/home/salotz/anaconda3/bin/python
Out[4]:
masked_array(data = [-- -inf 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True False False False],
fill_value = 1e+20)
np.log
现在具有与mylog
相同的行为,但是np.ma.log
不变:In [5]: np.ma.log(np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0]))
Out[5]:
masked_array(data = [-- -- 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
有办法避免这种情况吗?
使用
Python 3.6.2 :: Anaconda custom (64-bit)
和numpy 1.12.1
最佳答案
只需弄清楚这里发生了什么np.ma.log
在参数上运行np.log
,但是会捕获警告:
In [26]: np.log([-1,0,1,2])
/usr/local/bin/ipython3:1: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log
#!/usr/bin/python3
/usr/local/bin/ipython3:1: RuntimeWarning: invalid value encountered in log
#!/usr/bin/python3
Out[26]: array([ nan, -inf, 0. , 0.69314718])
它掩盖了
nan
和-inf
值。并且显然将原始值复制到这些data
插槽中:In [27]: np.ma.log([-1,0,1,2])
Out[27]:
masked_array(data = [-- -- 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
In [28]: _.data
Out[28]: array([-1. , 0. , 0. , 0.69314718])
(在Py3中运行; numpy版本1.13.1)
这种掩盖行为不是
ma.log
独有的。由其类别决定In [41]: type(np.ma.log)
Out[41]: numpy.ma.core._MaskedUnaryOperation
在
np.ma.core
中,它用fill
和domain
属性定义:log = _MaskedUnaryOperation(umath.log, 1.0,
_DomainGreater(0.0))
因此,有效域(未屏蔽)> 0:
In [47]: np.ma.log.domain([-1,0,1,2])
Out[47]: array([ True, True, False, False], dtype=bool)
该域掩码为
or-ed
In [54]: ~np.isfinite(np.log([-1,0,1,2]))
...
Out[54]: array([ True, True, False, False], dtype=bool)
具有相同的值。
看起来我可以定义一个自定义
log
,它不会添加自己的域掩码:In [58]: mylog = np.ma.core._MaskedUnaryOperation(np.core.umath.log)
In [59]: mylog([-1,0,1,2])
Out[59]:
masked_array(data = [ nan -inf 0. 0.69314718],
mask = False,
fill_value = 1e+20)
In [63]: np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0])
Out[63]:
masked_array(data = [-- 0 1 2],
mask = [ True False False False],
fill_value = 999999)
In [64]: np.ma.log(np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0]))
Out[64]:
masked_array(data = [-- -- 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True True False False],
fill_value = 1e+20)
In [65]: mylog(np.ma.masked_array([-1,0,1,2],[1,0,0,0]))
Out[65]:
masked_array(data = [-- -inf 0.0 0.6931471805599453],
mask = [ True False False False],
fill_value = 1e+20)
关于python - 对numpy被屏蔽数组的操作给出被屏蔽的无效值,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/46983061/