我一直试图找出一种方法来基于两列的值选择唯一的行。例如,这是我的文件的示例/示例:

chr1    10    12
chr1    10    12
chr1    10    11
chr1    9    12
chr2    15    20

这就是我希望我的输出看起来像的样子:
chr1    10    12
chr1    10    11
chr1    9    12
chr2    15    20

我尝试使用此代码,因为我喜欢它不会弄乱我的文件的顺序:
awk -F"\t" '!_[$2]++' SNP_positions.txt > SNP_positions_uniq.txt

但是,它仅捕获一列的独特功能。有没有一种方法可以对其进行编辑以使其适用于两列?

最佳答案

您可以完美地使用对数组元素使用多个字段的索引:

awk -F"\t" '!seen[$2, $3]++' file

在这种情况下,我们使用$2, $3作为索引。这样,我们将获得元组($2, $3)的所有不同元素。

10-07 21:15