我一直试图找出一种方法来基于两列的值选择唯一的行。例如,这是我的文件的示例/示例:
chr1 10 12
chr1 10 12
chr1 10 11
chr1 9 12
chr2 15 20
这就是我希望我的输出看起来像的样子:
chr1 10 12
chr1 10 11
chr1 9 12
chr2 15 20
我尝试使用此代码,因为我喜欢它不会弄乱我的文件的顺序:
awk -F"\t" '!_[$2]++' SNP_positions.txt > SNP_positions_uniq.txt
但是,它仅捕获一列的独特功能。有没有一种方法可以对其进行编辑以使其适用于两列?
最佳答案
您可以完美地使用对数组元素使用多个字段的索引:
awk -F"\t" '!seen[$2, $3]++' file
在这种情况下,我们使用
$2, $3
作为索引。这样,我们将获得元组($2, $3)
的所有不同元素。