相关问题:


Dependency package "package_name" not available
How to make devtools::test() consider package dependencies


我有两个自制软件包,A和B。B依赖于A的某些功能,并且在DESCRIPTION文件中具有A,如下所示:

Depends: A

我有使用testthat编写的单元测试。加载B通常可以正常工作,而手动运行测试(将代码作为块运行)可以正常工作。但是,尝试对devtools::test()使用自动测试会失败:

>devtools::test()
Loading B
Error in (function (dep_name, dep_ver = NA, dep_compare = NA)  :
  Dependency package A not available.


由于它在自己的环境中运行,因此我不知道如何开始调试它,因此我什至无法打印任何内容。我怀疑是.libPaths()问题,但无法确认。

我不知道如何最小化重现该问题,并且由于该代码是专有的,因此我无法共享该代码。

traceback()致电:

> traceback()
6: stop("Dependency package ", dep_name, " not available.")
5: (function (dep_name, dep_ver = NA, dep_compare = NA)
   {
       if (!requireNamespace(dep_name, quietly = TRUE)) {
           stop("Dependency package ", dep_name, " not available.")
       }
       if (xor(is.na(dep_ver), is.na(dep_compare))) {
           stop("dep_ver and dep_compare must be both NA or both non-NA")
       }
       else if (!is.na(dep_ver) && !is.na(dep_compare)) {
           compare <- match.fun(dep_compare)
           if (!compare(as.numeric_version(getNamespaceVersion(dep_name)),
               as.numeric_version(dep_ver))) {
               warning("Need ", dep_name, " ", dep_compare, " ",
                   dep_ver, " but loaded version is ", getNamespaceVersion(dep_name))
           }
       }
       return(TRUE)
   })(dots[[1L]][[5L]], dots[[2L]][[5L]], dots[[3L]][[5L]])
4: mapply(check_dep_version, deps$name, deps$version, deps$compare)
3: load_depends(pkg)
2: load_all(pkg, quiet = TRUE)
1: devtools::test()


sessionInfo()

> sessionInfo()
R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Linux Mint 18.2

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/libblas/libblas.so.3.6.0
LAPACK: /usr/lib/lapack/liblapack.so.3.6.0

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=en_US.UTF-8
 [6] LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.17                          bindr_0.1.1                           xml2_1.2.0
 [4] magrittr_1.5                          roxygen2_6.0.1                        devtools_1.13.6
 [7] tidyselect_0.2.4                      R6_2.2.2                              rlang_0.2.1
[10] stringr_1.3.1                         plyr_1.8.4                            dplyr_0.7.6
[13] tools_3.4.4                           B_1.0                                 withr_2.1.2
[16] commonmark_1.5                        digest_0.6.15                         assertthat_0.2.0
[19] tibble_1.4.2                          bindrcpp_0.2.2                        purrr_0.2.5
[22] testthat_2.0.0                        memoise_1.1.0                         glue_1.3.0
[25] stringi_1.2.3                         compiler_3.4.4                        pillar_1.2.3
[28] pkgconfig_2.0.1

最佳答案

可以使用debugonce()函数上的devtools::test()调试情况。这允许交互式调试测试环境。

调用installed.packages()表示没有问题,即程序包A和B安装在正确的路径中。

使用debugonce(),我从devtools::test()devtools:::load_depends()devtools:::check_dep_version()requireNamespace()失败了,并出现以下错误:

Loading required namespace: A
Failed with error:  ‘object 'mutate' not found whilst loading namespace 'A'’


因此,显然,涉及mutate()方法的某种隐藏的名称空间错误。问题是quiet=TRUErequireNamespace()处于打开状态,并且不可更改,因此错误消息不会传递给用户,将其发送到错误的路径。

因此答案竟然与先前的问题I had answered before类似,只是没有意识到联系。

关于r - devtools::test()失败:依赖包X不可用,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/51485368/

10-12 17:35