我尝试Knit HTML以下Rmd文件:
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title: "Untitled"
author: "Florian Privé"
date: "12 septembre 2016"
output: html_document
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```{r fibCpp, engine='Rcpp'}
#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::export]]
int fibonacci(const int x) {
if (x == 0 || x == 1) return(x);
return (fibonacci(x - 1)) + fibonacci(x - 2);
}
```
我收到以下错误:
Building shared library for Rcpp code chunk...
Warning message:
l'exécution de la commande 'make -f "C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/etc/x64/Makeconf" -f "C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/share/make/winshlib.mk" SHLIB_LDFLAGS='$(SHLIB_CXXLDFLAGS)' SHLIB_LD='$(SHLIB_CXXLD)' SHLIB="sourceCpp_2.dll" WIN=64 TCLBIN=64 OBJECTS="file110c1d4643e9.o"' renvoie un statut 127
Quitting from lines 11-18 (test.Rmd)
Error in (function (file = "", code = NULL, env = globalenv(), embeddedR = TRUE, :
Error 1 occurred building shared library.
Calls: <Anonymous> ... block_exec -> in_dir -> engine -> do.call -> <Anonymous>
Exécution arrêtée
我做错了什么吗？与Windows有关吗？
来自
sessionInfo()的环境信息R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
locale:
[1] LC_COLLATE=French_France.1252 LC_CTYPE=French_France.1252
[3] LC_MONETARY=French_France.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=French_France.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] magrittr_1.5 rsconnect_0.4.3 htmltools_0.3.5 tools_3.3.1 yaml_2.1.13
[6] Rcpp_0.12.7 stringi_1.1.1 rmarkdown_1.0 stringr_1.1.0 digest_0.6.10
[11] evaluate_0.9
Rtools通过
devtools::find_rtools()安装检查[1] TRUE
Sys.getenv()['PATH']的结果## PATH C:\Program
## Files\R\R-3.3.1\bin\x64;C:\ProgramData\Oracle\Java\javapath;C:\Program
## Files\NVIDIA GPU Computing
## Toolkit\CUDA\v7.5\bin;C:\Program
## Files\NVIDIA GPU Computing
## Toolkit\CUDA\v7.5\libnvvp;;C:\Program Files
## (x86)\Intel\iCLS Client\;C:\Program
## Files\Intel\iCLS
## Client\;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program
## Files (x86)\Windows Live\Shared;C:\Program
## Files\Intel\Intel(R) Management Engine
## Components\DAL;C:\Program
## Files\Intel\Intel(R) Management Engine
## Components\IPT;C:\Program Files
## (x86)\Intel\Intel(R) Management Engine
## Components\DAL;C:\Program Files
## (x86)\Intel\Intel(R) Management Engine
## Components\IPT;C:\Program Files
## (x86)\Skype\Phone\;C:\Users\Florian\.dnx\bin;C:\Program
## Files\Microsoft DNX\Dnvm\;C:\Program Files
## (x86)\NVIDIA
## Corporation\PhysX\Common;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Users\Florian\Anaconda3;C:\Users\Florian\Anaconda3\Scripts;C:\Users\Florian\Anaconda3\Library\bin;C:\Program
## Files
## (x86)\Java\jre1.8.0_101\bin\client;C:\texlive\2015\bin\win32
最佳答案
所请求的 Sys.getenv['PATH'] 信息中不包含带有Rtools的路径，并且知道knitr错误是由无效的引擎路径触发的，我认为您已成为devtools::find_rtools()的受害者，在安装时抛出了误报。
通常是这种情况，因为如果无法在系统路径上找到Rtools，它将在注册表中扫描Rtools，然后设置一个环境标志。在运行rmarkdown或程序包构建阶段，环境标志通常不会持久存在。另请参阅:Why do I need to run find_rtools() before has_devel() = TRUE?
例如。如果关闭所有打开的 session R session ，然后打开一个新的 R session ，仅键入Rcpp::evalCpp("2 + 2")，您可能会触发编译错误。
解决方法很简单:将Rtools安装位置添加到PATH系统变量中。 我维护着一个安装指南，该指南从字面上指导您逐步完成此过程:http://thecoatlessprofessor.com/programming/rcpp/install-rtools-for-rcpp/
从Rtools 3.4开始，必须添加到PATH中的两个位置是:
c:\Rtools\bin;
c:\Rtools\mingw_32\bin;
要在Windows上修改
PATH变量，请参见:关于r - 无法在R Markdown中使用Rcpp引擎，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/39456577/