我一直在努力学习Cython来加速我的一些计算。下面是我要做的一部分:这只是在使用NumPy数组的同时使用递归公式积分微分方程。与纯python版本相比,我已经实现了大约100倍的速度增长。不过,通过查看由-a
cython命令为代码生成的HTML文件,似乎可以提高速度。我的代码如下所示(我想将HTML文件中变为黄色的行标记为白色):
%%cython
import numpy as np
cimport numpy as np
cimport cython
from libc.math cimport exp,sqrt
@cython.boundscheck(False)
cdef double riccati_int(double j, double w, double h, double an, double d):
cdef:
double W
double an1
W = sqrt(w**2 + d**2)
#dark_yellow
an1 = ((d - (W + w) * an) * exp(-2 * W * h / j ) - d - (W - w) * an) /
((d * an - W + w) * exp(-2 * W * h / j) - d * an - W - w)
return an1
def acalc(double j, double w):
cdef:
int xpos, i, n
np.ndarray[np.int_t, ndim=1] xvals
np.ndarray[np.double_t, ndim=1] h, a
xpos = 74
xvals = np.array([0, 8, 23, 123, 218], dtype=np.int) #dark_yellow
h = np.array([1, .1, .01, .1], dtype=np.double) #dark_yellow
a = np.empty(219, dtype=np.double) #dark_yellow
a[0] = 1 / (w + sqrt(w**2 + 1)) #light_yellow
for i in range(h.size): #dark_yellow
for n in range(xvals[i], xvals[i + 1]): #light_yellow
if n < xpos:
a[n+1] = riccati_int(j, w, h[i], a[n], 1.) #light_yellow
else:
a[n+1] = riccati_int(j, w, h[i], a[n], 0.) #light_yellow
return a
在我看来,我上面标记的9条线都应该可以通过适当的调整变成白色。一个问题是能够以正确的方式定义NumPy数组。但更重要的可能是使第一个标记行高效工作的能力,因为这是进行大部分计算的地方。我试着读取HTML文件在点击一条黄线后显示的生成的C代码,但我真的不知道如何读取该代码。如果有人能帮我,我将不胜感激。
最佳答案
我想你不必在意那些不在圈里的黄线。添加以下编译器指令将使循环中的三行更快:
@cython.cdivision(True)
cdef double riccati_int(double j, double w, double h, double an, double d):
pass
@cython.boundscheck(False)
@cython.wraparound(False)
def acalc(double j, double w):
pass