我正在使用 perpflot 库来测试 DatetimeIndex 对搜索 Pandas 数据帧的影响。
我定义了一个设置函数来创建 2 个数据帧。一个带有日期时间索引，另一个带有时间作为列。我还定义了 2 个函数，它们分别在索引和列中使用 .loc 并返回子数据。但是，它向我显示了 typeError 。
TypeError: ufunc 'isfinite' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''
代码:
import numpy as np
import pandas as pd
from datetime import datetime
import perfplot
def setup_code(n):
timeline = pd.date_range(end=datetime.now(), freq='1s', periods=n)
sensor_readings = np.random.randint(100, size=(n, 4))
col_labels = ['Sensor1', 'Sensor2', 'Sensor3', 'Sensor4']
data = pd.DataFrame(sensor_readings, columns=col_labels)
data['time'] = timeline
data['time'] = pd.to_datetime(data['time'])
data2 = data.copy()
data2 = data2.set_index('time')
print(n)
return [data, data2]
def f1(ldata):
data = ldata[0]
subdata = data.loc[(data['time'] >= '2019-06-21 08:00:00') & (data['time'] <= '2019-06-21 11:00:00')]
return subdata
def f2(ldata):
data = ldata[1]
subdata = data.loc['2019-06-21 04:00:00':'2019-06-21 10:00:00']
return subdata
out = perfplot.bench(
setup=setup_code,
kernels=[
f1, f2
],
n_range=[1000 ** k for k in range(1, 3)],
labels=['Without Indexing', 'With Indexing'],
xlabel='Length of DataFrame'
)
out.show()
追溯:
Traceback (most recent call last): | 0/2 [00:00<?, ?it/s]
File ".\scratchpad.py", line 39, in <module>
xlabel='Length of DataFrame'
File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\perfplot\main.py", line 128, in bench
reference, kernel(data)
File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\numpy\core\numeric.py", line 2423, in allclose
res = all(isclose(a, b, rtol=rtol, atol=atol, equal_nan=equal_nan))
File "C:\Users\hpandya\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\numpy\core\numeric.py", line 2521, in isclose
xfin = isfinite(x)
TypeError: ufunc 'isfinite' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''
奇怪的是，它在我定义
xlabel 的行上显示错误。我觉得我在这里遗漏了一些微不足道的东西。 最佳答案
bench() 和 show() 方法默认比较内核输出以确保所有方法产生相同的输出(为了正确性)。检查是使用 numpy 函数完成的，该函数可能不适用于所有情况或所有内核输出。
你想要做的是指定一个 equality_check 参数，它允许在如何比较输出方面具有一定的灵活性。这在比较 numpy 无法很好处理的字符串或字典的迭代等内容时特别有用。
如果您确信您的函数是正确的，请将 equality_check 设置为 None，否则传递一些实现您自己的检查逻辑的可调用对象。
out = perfplot.bench(
...
equality_check=lambda x, y: x.equals(y) # equality_check=None
)
有关如何使用
equality_check 为不同功能计时的更多示例，请参阅 this answer(滚动到底部)。关于python - Perfplot bench() 引发 "TypeError: ufunc ' isfinite' 不支持输入类型，并且输入类型“，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/56708872/