我最近从亚马逊下载了2013 Rcpp书,以学习如何更好地将C++与我的R代码一起使用,并且我正在尝试第一个带有第一个fibonacci递归函数和包装器的编译示例,以查看是否可以做到这一点。我正在使用最新R的Ubuntu。
首先我的C++:
/* Cpp based recurive function */
int fibonacci(const int x){
if(x == 0) return(0);
if(x == 1) return(1);
return(fibonacci(x - 1) + fibonacci(x - 2));
}
/* Wrapper */
extern "C" SEXP fibWrapper(SEXP xs) {
int x = Rcpp::as<int>(xs);
int fib = fibonacci(x);
return(Rcpp::wrap(fib));
}
然后我开始sh并输入:
PKG_CXXFLAGS=`Rscript -e 'Rcpp:::CxxFlags()'`
PKG_LIBS=`Rscript -e 'Rcpp:::LdFlags()'`
R CMD SHLIB Fibonacci.cpp
但是我得到:
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c Fibonacci.cpp -o Fibonacci.o
Fibbonacci.cpp:10:12: error: 'SEXP' does not name a type
make: *** [Fibonacci.o] Error 1
我想也许我的C++代码中需要include指令,所以我再做一次,但是这次是在C++文件的顶部加上
#include<Rcpp.h>
,并再次在sh中执行相同的命令,但仍然不高兴:g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c Fibonacci.cpp -o Fibonacci.o
Fibonacci.cpp:1:18: fatal error: Rcpp.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [Fibbonacci.o] Error 1
我做错了什么?
如果查询在sh中设置的值:
$PKG_CXXFLAGS
sh: 9: -I/local/yrq12edu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/include: not found
$PKG_LIBS
sh: 10: -L/local/yrq12edu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/lib: not found
但我认为未找到的消息只是由于-L标志,因为如果我将CD cd到目录,则文件在那里。
谢谢,
本
最佳答案
您似乎忽略了一个重要的细节。当你做
PKG_CXXFLAGS=`Rscript -e 'Rcpp:::CxxFlags()'`
PKG_LIBS=`Rscript -e 'Rcpp:::LdFlags()'`
R CMD SHLIB Fibonacci.cpp
前两个的结果应分配并导出到 shell 。您在这里所做的“分配和忘记”。
您从 list 2.1中错过了这一点(显示了这本书(或者可能是电子书删除了它-我没有电子书))是非常重要的结尾反斜杠,它使所有内容变成一行:
PKG_CXXFLAGS=`Rscript -e 'Rcpp:::CxxFlags()'` \
PKG_LIBS=`Rscript -e 'Rcpp:::LdFlags()'` \
R CMD SHLIB Fibonacci.cpp
现在,赋值与对R(shell脚本本身)的调用在相同的执行中发生,它具有值,并将其传递给g++。
您可以通过接下来的两行告诉我,其中我完全引用了包含所有必需的-I和-L部分的结果命令。因此,两者(编译和链接步骤)都要经过多行。
因此,这本书是正确的,并且按照所示方式进行所有操作。内联(在本章后面讨论)和属性(也在本章的后面讨论)都基本上为您分配了
PKG_CXXFLAGS
和PKG_LIBS
分配。编辑:另外,您的测试是错误的。你的意思可能是这个
$ PKG_CXXFLAGS=`Rscript -e 'Rcpp:::CxxFlags()'`
$ echo $PKG_CXXFLAGS
-I/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include
$
您不能只是“调用” shell变量,因此会得到“未找到”的答案。
编辑2:无论如何,您尝试过的示例实际上就是为了激发第2.4节中的其余讨论,该节详细介绍了如何费力,容易出错...这是-导致关于内联的第2.5和2.6节和属性。两者都更好。用那些。
关于c++ - rcpp第一次编译麻烦,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/19140348/