我在macOS sierra(10.12.5)上运行R(版本3.4.0),并且尝试使用xlsx库,该库要求使用rJava库。
当我尝试在R控制台中使用library(rJava)
加载rJava时(无论是在RStudio中还是在终端中),都会收到以下错误消息,使我难以理解:
Fehler: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad in loadNamespace() für 'rJava' fehlgeschlagen, Details:
Aufruf: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
Fehler: kann shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so' nicht laden:
dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
Reason: image not found
在这个问题上进行了搜索,我发现了很多类似的帖子(但每次都有一些稍有不同的问题),其中this SO question是最有前途的。
由于建议的步骤需要适应我的情况,而且我是一个新手,因此我无法实现它们。我能做什么?
附加信息:
shell命令
java -version
返回:java version "1.8.0_131"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_131-b11)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.131-b11, mixed mode)
然后,shell命令
R CMD javareconf
返回:Java interpreter : /usr/bin/java
Java version : 1.8.0_131
Java home path : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java compiler : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
Non-system Java on macOS
trying to compile and link a JNI program
detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include/darwin -I/usr/local/include -fPIC -Wall -g -O2 -c conftest.c -o conftest.o
clang -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress - L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o conftest.so conftest.o -L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
JAVA_HOME /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/server
JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Updating Java configuration in /Library/Frameworks/R.framework/Resources
Done.
任何帮助将不胜感激!
最佳答案
有用!
在安装并重新安装了不同的Java版本并使用R命令install.packages("rJava")
重新安装了rJava之后,我发现在R控制台(shell窗口)中加载库不再抛出错误消息。
之后,我可以通过运行以下shell命令,使用this post中的答案使其在RStudio中工作:
sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib
毕竟不太复杂!谢谢大家的耐心配合。
关于java - R,加载rJava错误,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/44157869/