r - 如何使用Docker将Rmarkdown转换为HTML？

如何使用Docker将以下test.rmd转换为.html文档给输出？

我无法在这里找到简短的示例，而无需在Docker容器中设置RStudio。

test.rmd

---
title: "Test"
author: "John Doe"
date: "5/15/2019"
output:
  html_document:
    theme: lumen
---

## R Markdown

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## Scatter Plot

```{r}
library(ggplot2)

ggplot(mpg, aes(displ, hwy, colour = class)) +
  geom_point()
``

最佳答案

这是一个基于Rocker container I made for Rmd的答案(有两次更正/更改)，我已经在本地使用了。它是相当最小的:R加rmarkdown加上完整的LaTeX堆栈(那方面对我来说很重要，可能对您而言不重要)，而ggplot2很少。您可以从Rocker account at the Docker Hub使用标准docker pull rocker/r-rmd下载它。

我必须对您的Rmd文件进行两项更改。首先，我在最后一行添加了缺失的第三个反引号。然后，我还必须删除流明主题。那可能来自另一个软件包-我不记得了。之后，以下命令可以解决问题(您的示例另存为file.Rmd):

docker run --rm -ti -v${PWD}:/work -w/work \
    rocker/r-rmd Rscript -e 'rmarkdown::render("file.Rmd")'

在我的盒子上输出日志

edd@rob:~/git/stackoverflow/56157292(master)$ docker run --rm -ti -v${PWD}:/work -w/work rocker/r-rmd Rscript -e 'rmarkdown::render("file.Rmd")'


processing file: file.Rmd
  |................................                                 |  50%
  ordinary text without R code

  |.................................................................| 100%
label: unnamed-chunk-1

output file: file.knit.md

/usr/bin/pandoc +RTS -K512m -RTS file.utf8.md --to html4 --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash+smart --output file.html --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template /usr/lib/R/site-library/rmarkdown/rmd/h/default.html --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable 'theme:bootstrap' --include-in-header /tmp/Rtmp6683qu/rmarkdown-str1417442cc.html --mathjax --variable 'mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML'

Output created: file.html
edd@rob:~/git/stackoverflow/56157292(master)$

渲染输出

关于r - 如何使用Docker将Rmarkdown转换为HTML？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/56157292/