winbugs - 指定burnin和thinning时JAGS/BUGS节省了多少迭代？

我有一个关于在 JAGS 和 BUGS 中运行模型的详细信息的快速问题。

假设我使用 n.burnin=5000 、 n.iter=5000 和 thin=2 运行模型。这是否意味着该程序将:

运行5000次迭代，丢弃结果；然后

再运行 10,000 次迭代，只保留每秒结果？

如果我将这些模拟保存为 CODA 对象，是全部保存了 10,000 个，还是仅保存了 5,000 个？我只是想了解使用哪一组迭代来制作 ACF 图？

最佳答案

使用 JAGS，n.burnin=5000, n.iter=5000 and thin=2 意味着您什么都不保留。您运行 5000，丢弃这 5000 个中的前 5000 个，然后只保留链中剩余值的一半(保留 1 个值并丢弃下一个 ..)。

使用例如 n.burnin=2000, n.iter=7000, thin=50, n.chains=5 :所以你有 (7000-2000)/50 * 5 = 500 个值。

关于winbugs - 指定burnin和thinning时JAGS/BUGS节省了多少迭代？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/14680488/