linux - 如何使用awk逐行打印其他程序的结果？

我有一个file.txt文件如下：

AAAAAA
AAAAAB
AAAAAC
AAAAAD
...

我想一次用一条线做另一个程序。我的脚本正在使用awk，它几乎完成了，但仍然没有工作。有人能帮忙吗？谢谢！

while read file.txt

line=`awk '{ print $0 ; next}' ../file.txt`

echo 'for aa in "$line": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb' > script.pdb

do

pymol script.pdb

done

脚本应该单独读取file.txt的每一行，以使用'for aa in“$line”：cmd._alt（string.lower（aa））；save$line.pdb'脚本中的行，用于pymol。
因此，预期的输出应该是包含每个文件的文件夹：
AAAAAA.pdb AAAAAB.pdb AAAAAC.pdb

最佳答案

你可以试试

while read -r line
do
    echo "for aa in \"$line\": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb" > script.pdb
    pymol script.pdb
done < file.txt

关于linux - 如何使用awk逐行打印其他程序的结果？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/33304549/