我需要从 rserve 开始并继续运行 R

我的 rserve.r 文件中有这些行:

library(Rserve)
Rserve()

所以,我试图在我的 Upstart 脚本中做这样的事情:
description "Rserve service"
author      "Valter Silva"

start on filesystem or runlevel [2345]
stop on shutdown

respawn

script
    echo $$ > /var/run/rserve.pid
    exec /usr/bin/R /home/valter/R/rserve.R >> /home/valter/test2.log
end script


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> /var/log/rserve.log
end script

pre-stop script
    rm /var/run/rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> /var/log/rserve.log
end script

我知道服务运行是因为我的文件 test2.log 的输出。但它只运行一次。我该怎么做才能让它继续运行?

最佳答案

你(和我)遇到这么多麻烦的原因是我们问错了问题。正确的问题是“ 如何从我们的客户端代码启动 Rserve?” Java(和大多数其他)客户端具有 StartRserve 的能力。

这个问题的答案在 java 库中:How to start Rserve automatically from Java?

或者这里是 C# 库:
https://github.com/SurajGupta/RserveCLI2/blob/master/RServeCLI2.Test/Rservice.cs

另一种方法是向 the best 学习。 Rocker 项目复制 supervisor.conf
/etc/supervisor/conf.d/(见 https://github.com/rocker-org/rocker/blob/master/rstudio/Dockerfile#L61 )

你的 supervisor.conf 可以添加类似的东西

[program:Rserve]
command=/usr/bin/Rserve.sh
stdout_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
stderr_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
user=myuser
startsecs=0
autorestart=false
exitcodes=0

但 ...
我确实弄清楚了。所以这就是答案。我很抱歉它有点笨拙和分散。对我来说,我最大的障碍是将我的启动/停止脚本放在 /usr/bin 文件夹中(见下面的讨论)
/etc/init/Rserve.conf
description "Rserve service"
author "Victor I. Wood"
version "0.01"

# based on
# https://stackoverflow.com/questions/32485131/how-to-make-an-upstart-service-to-rserve

env STARTSCRIPT=/usr/bin/Rserve.sh
env STOPSCRIPT=/usr/bin/Rserve.stop
env LOGFILE=/var/log/Rserve.log


start on runlevel [2345]
stop on runlevel [!2345]

console output

respawn

# tell upstart we're creating a daemon
# upstart manages PID creation for you.
expect fork


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> $LOGFILE
    echo $$ > /var/run/Rserve.pid
end script

pre-stop script
    rm /var/run/Rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> $LOGFILE
    exec $STOPSCRIPT >> $LOGFILE
end script


script
        # My startup script, plain old shell scripting here.
        exec $STARTSCRIPT >> $LOGFILE
#       echo $$ > /var/run/rserve.pid
end script
/usr/bin/Rserve.sh
#!/bin/sh
sudo --login --set-home --user=myuser bash -c '~/Rserve.sh >~/Rserve.log 2>&1'
/usr/bin/Rserve.stop
#!/bin/sh
pkill -U myuser Rserve
/home/myuser/Rserve.sh
#!/bin/sh

# launch new Rserve process
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1

我从脚本开始
https://askubuntu.com/questions/62729/how-do-i-set-up-a-service?lq=1
并注意到 initctl start 可能会在调试时派上用场。

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1
注意到脚本必须在 /bin 中(但我使用了 /usr/bin ),并且必须由 root 拥有。有些人喜欢使用指向其他地方的脚本的链接作为脚本 i /bin
作为 How to make an upstart service to Rserve? 的人们
已经建议,我正在使用我在 rServe 文档中找到的 Rserve start 命令
R CMD Rserve

虽然我已经将我的扩展到
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

我没有导出正确的 pid,所以我用 pkill 停止它。更优雅的方法是
RSshutdown(rsc)

How can I shut down Rserve gracefully?

stdout 和 stderr 混淆了 Upstart ,因此使用 2>&1 重定向所有输出
How to redirect both stdout and stderr to a file

当我发现的时候我有点想通了
https://www.digitalocean.com/community/tutorials/the-upstart-event-system-what-it-is-and-how-to-use-it

https://geeknme.wordpress.com/2009/10/15/getting-started-with-upstart-in-ubuntu/
http://blog.joshsoftware.com/2012/02/14/upstart-scripts-in-ubuntu/
但对于那些只想开始的人来说,这些是比官方文档更实用的起点。

更新

此解决方案假设 Upstart,这是最初的问题,但 Upstart 不再是默认的服务管理器。如果您想在 16.04 之后的系统上执行此操作,请改回 Upstart
sudo apt-get install upstart-sysv
sudo update-initramfs -u
sudo apt-get purge systemd

(来自 http://notesofaprogrammer.blogspot.com/2016/09/running-upstart-on-ubuntu-1604-lts.html )

关于r - 如何为 Rserve 提供 Upstart 服务?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/32485131/

10-12 20:45