r - conda 通过MKL安装r-essentials

在我的RHEL服务器上，我没有管理员权限，但是可以创建Conda环境。我想使用Intel MKL(英特尔®数学内核库)创建一个运行R的Conda环境。

我用R_defaults.yml创建环境，运行$> conda env create --file R_defaults.yml:

name: R_defaults
channels:
  - defaults
  - conda-forge
dependencies:
  - pkgs/r::r-essentials=3.6.0=r36_0

激活环境，启动R和sessionInfo()，我得到未使用MKL的信息:

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-conda_cos6-linux-gnu (64-bit)
Running under: Red Hat Enterprise Linux Server 7.7 (Maipo)

Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /home/geiringe/miniconda3/envs/R_r/lib/R/lib/libRblas.so

Microsoft R Open(https://mran.microsoft.com/download)可以与MKL一起安装。

似乎Anaconda已经改变了对Microsoft R Open的看法。在2018年6月，据说它已成为Anaconda发行版(https://www.anaconda.com/introducing-microsoft-r-open-as-default-r-for-anaconda-distribution/)的默认R.现在他们希望我们从Microsoft R Open迁移过来，并且他们将不会更新MRO软件包(https://docs.anaconda.com/anaconda/user-guide/tasks/using-r-language/#switch-an-environment-from-r-to-mro)。 r::mro-base的最新版本为3.5.1，并且已有1年以上的历史。 r::r-essentials的最新版本是3.6.0

我有办法用R的更新版本和MKL创建Conda环境吗？

最佳答案

优先考虑Conda Forge并显式指定libblas构建对我有用( osx-64 )。例如。，

YAML

name: R_mkl
channels:
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - conda-forge::r-essentials=3.6
  - conda-forge::libblas=3.8.0=14_mkl

激活的环境中R -e "sessionInfo()"的输出:

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: macOS Mojave 10.14.6

Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /Users/mfansler/miniconda3/envs/r_mkl/lib/libmkl_rt.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.1

希望它与 linux-64 类似。

关于r - conda 通过MKL安装r-essentials，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/58834940/