我正在处理XML数据集(DrugBank数据库可用here),其中某些字段包含转义的XML字符,例如“&”等。
为了使问题更具体,这是一个示例方案:
<drugs>
<drug>
<drugbank-id>DB00001</drugbank-id>
<general-references>
# Askari AT, Lincoff AM: Antithrombotic Drug Therapy in Cardiovascular Disease. 2009 Oct; pp. 440–. ISBN 9781603272346. "Google books":http://books.google.com/books?id=iadLoXoQkWEC&pg=PA440.
</general-references>
.
</drug>
<drug>
...
</drug>
...
</drugs>
由于整个文档非常庞大,因此我将其解析如下:
VTDGen gen = new VTDGen();
try {
gen.setDoc(Files.readAllBytes(DRUGBANK_XML));
gen.parse(true);
} catch (IOException | ParseException e) {
SystemHelper.exitWithMessage(e, "Unable to process Drugbank XML data. Aborting.");
}
VTDNav nav = gen.getNav();
AutoPilot pilot = new AutoPilot(nav);
pilot.selectXPath("//drugs/drug");
while (pilot.evalXPath() != -1) {
long fragment = nav.getContentFragment();
String drugXML = nav.toString((int) fragment, (int) (fragment >> 32));
System.out.println(drugXML);
finerParse(drugXML); // another method handling a more detailed data analysis
}
当我使用示例xml(从相同数据复制粘贴的片段)测试
finerParse
方法时,它工作正常。但是,从上面的代码调用时,它失败并显示错误消息Errors in Entity: Illegal entity char
。将输入打印到finerParse
(即drugXML
字符串)后,我注意到原始xml中的字符串&pg=PA440
更改为“&pg = PA440”。为什么会这样呢?我正在做的就是使用一个非常著名的解析器来解析它。
附言我找到了一个替代解决方案,我只是将VTDNav作为参数传递给
finerParse
,而不是首先获取内容字符串并传递该字符串。但是我仍然对上述方法出了什么问题感到好奇。 最佳答案
应该使用vtdNav.toRawString()而不是vtdNav.toString()来解决问题……让我知道它是否有效。