我有一个字符串,其中有一些需要从中提取的值。例如:"FEFEWFSTARTFFFPENDDCDC"
。我怎么能做一个从"START"
一直到"END"
的切片的表达式?
我以前尝试通过创建使用for
循环和string.find("START")
来定位起点和终点的函数来做到这一点,但这似乎并没有有效地工作,而且看起来过于复杂。有没有更简单的方法而无需使用复杂的循环?
编辑:
忘记了这部分。如果最终值不同,该怎么办?换句话说,值"END"
和"DONE"
不仅会以"NOMORE"
结尾,还会结束吗?除此之外,整个字符串中还有多个开始和结束。例如:"STARTFFEFFDONEFEWFSTARTFEFFENDDDW"
。
EDIT2:样品运行:起始值:ATG。最终值:TAG,TAA,TGA
"Enter a string": TTATGTTTTAAGGATGGGGCGTTAGTT
TTT
GGGCGT
和
"Enter a string": TGTGTGTATAT
"No string found"
最佳答案
这非常适合正则表达式:
>>> import re
>>> s = "FEFEWFSTARTFFFPENDDCDCSTARTDOINVOIJHSDFDONEDFOIER"
>>> re.findall("START.*?(?:END|DONE|NOMORE)", s)
['STARTFFFPEND', 'STARTDOINVOIJHSDFDONE']
.*
可以匹配任意数量的字符(换行符除外),附加的?
会使量词变得懒惰,告诉它尽可能少地匹配字符。否则,将只有一个匹配项,即STARTFFFPENDDCDCSTARTDOINVOIJHSDFDONE
。正如@BurhanKhalid指出的,如果添加capturing group,则仅捕获与该正则表达式的该部分匹配的子字符串:
>>> re.findall("START(.*?)(?:END|DONE|NOMORE)", s)
['FFFP', 'DOINVOIJHSDF']
说明:
START # Match "START"
( # Match and capture in group number 1:
.*? # Any character, any number of times, as few as possible
) # End of capturing group 1
(?: # Start a non-capturing group that matches...
END # "END"
| # or
DONE # "DONE"
| # or
NOMORE # "NOMORE"
) # End of non-capturing group
如果您的真正目标是匹配基因序列,则需要确保始终匹配三胞胎:
re.findall("ATG(?:.{3})*?(?:TA[AG]|TGA)", s)