r - 如何使用具有相同名称的字符变量调用对象

我试图在R中编写一个函数，以类似的方式批量分析许多文件。这些文件属于ExpressionSetIllumina类。我可以使用目录中所有文件的名称制作一个字符(字符串) vector ，并加载每个文件:

list = list.files()
for (i in list[1]) {
  load(i)
}

这样可以正确加载文件

> ls()
[1] "i"                    "list"                 "SSD.BA.vsn"
> class(SSD.BA.vsn)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

我现在想做的是使用i(字符串"SSD.BA.vsn")将对象SSD.BA.vsn分配给新的对象数据，以便:

>data = SomeFunction(i)
>class(data)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"

但是到目前为止，我所做的任何事情都只是将数据作为字符 vector 返回与i相同的值，或者根本不起作用。因此，我想知道是否有一个函数可以为我完成任务，还是我需要以其他方式解决这个问题。

我有一个以字符串形式存储在字符 vector 中的对象或变量的名称。如何使用字符串对象名称对对象执行某些操作？

最佳答案

我认为您想要 get 。

data <- get(i)

就是说，一旦开始使用get(及其对应的文件 assign )，通常会得到可怕的，无法读取的代码。

对于像您这样的批处理分析，通常最好将所有数据读入数据框列表，然后自由使用 lapply 。就像是:

data_files <- list.files()
all_vars <- lapply(data_files, function(file)
{
  vars_loaded <- load(file)
  mget(vars_loaded, parent.frame())
})

mget是get的版本，可一次检索多个变量。在这里，它用于检索调用调用所加载的所有内容。

现在，您有了一个列表列表:顶级列表与文件相关，低级列表包含从该文件加载的变量。