更新越来越近了。现在,我在应生成f2py模块的.pyf文件上运行_glmnet

我使用以下命令构建包python-glmnet包。

python setup.py config_fc --fcompiler=gnu95
                                           --f77flags='-fdefault-real-8'
                                          --f90flags='-fdefault-real-8' build


但是,当我导入模块时,出现此错误:


  文件“ /Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py”,第2行,在
  import _glmnet ImportError:没有名为_glmnet的模块


如何导入该模块?

glmnet目录还包含一个以以下内容开头的glmnet.pyf文件:

!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
            real*8 dimension(no,ni) :: x
            real*8 dimension(no),depend(no) :: y
            real*8 dimension(no),depend(no) :: w
            integer dimension(*) :: jd
            real*8 dimension(ni),depend(ni) :: vp
            integer optional,depend(x) :: ne=min(shape(x,1), nx)
            integer :: nx
            integer optional,check((flmin < 1.0 || len(ulam)==nlam)),depend(flmin,ulam) :: nlam=len(ulam)
            real*8 :: flmin
            real*8 dimension(nlam) :: ulam
            real*8 :: thr
            integer optional :: isd=1 ! Standardize predictors by default


更新

在哪里可以找到此_glmnet模块?是否包含在glmnet.pyf文件中,如下所示?我尝试将glment文件夹添加到我的PYTHONPATH中,但这没有任何改变。

~/221/tagger/tagger/glmnet master ls
__init__.py                  example_lasso_elastic_net.py glmnet.pyc
__init__.pyc                 glmnet.f                     glmnet.pyf
elastic_net.py               glmnet.py
~/221/tagger/tagger/glmnet master head -10 glmnet.pyf
!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
~/221/tagger/tagger/glmnet master echo $PYTHONPATH
/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet:
~/221/tagger/tagger/glmnet master cd ..
~/221/tagger/tagger master python main.py
Traceback (most recent call last):
  File "main.py", line 14, in <module>
    from glmnet import glmnet
  File "/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py", line 2, in <module>
    import _glmnet
ImportError: No module named _glmnet

最佳答案

据我所知,它正在寻找_gmlnet模块,该模块在gmlnet.pyf中定义。 gmlnet.pyf不是python模块,它是名为f2py的程序的一组附加说明,而python将忽略.pyf文件。您需要使用.pyf编译f2py文件和fortran文件。使用如下命令:

f2py -c --fcompiler=gnu95 gmlnet.pyf gmlnet.f


尝试安装f2py,然后重新安装gmlnet软件包。

关于python - Python glmnet“没有名为_glmnet的模块”,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/20459390/

10-12 04:01
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