c++ - 如何使用 MPI 发送 3D 数组的切片？

我有一个 3D 数组 Foo3D (50 x 100 x 100) 列 0 和 1。 Foo3D 分配如下:

int nx = 50;
int ny = 100;
int nz = 100;
typedef int nRarray[100][50];
nRarray *Foo3D;
if ((Foo3D = (nRarray *)malloc((nx*ny*nz)*sizeof(int))) == 0) {fprintf(stderr,"malloc1 Fail \n"); return 1;}

我将一些数字分配给排名 0 的 Foo3D 并将其保存到一个新的二维数组 ( Foo2D ) 中，如下所示:

if (myrank == 0) {
for (int j = 0; j < ny; j++) {
 for (int k = 0; k < nz; k++) {

   Foo3D[0][j][k] = j + k;
   Foo2D[j][k] = Foo3D[0][j][k];
}
 }
}

现在，我有兴趣将 Foo2D 发送到排名 1，并将其放置在 Foo3D 中的位置。事实上，我知道我可以将 Foo2D 发送到排名 1 为:

if (myrank == 0)
{
 MPI_Send(Foo2D,sizeof_Foo2D,MPI_INT,1,100,MPI_COMM_WORLD);
}
else if (myrank == 1)
{
 MPI_Recv(Foo2D,sizeof_Foo2D,MPI_INT,0,100,MPI_COMM_WORLD, &status);
}

然后将接收到的排名 1 的 Foo2D 分配到它在 Foo3D 中的位置，如下所示:

if (myrank == 1)
{
for (int j = 0; j < ny; j++) {
 for (int k = 0; k < nz; k++) {

   Foo3D[0][j][k] = Foo2D[j][k];
}
 }
}

不使用这个过程和 Foo2D 作为中间变量，是否可以将排名 0 中的 Foo3D 切片直接发送到 到它在排名 1 中的等效位置？事实上，我不想将整个 Foo3D 发送到 1 级，因为它是一个非常大的数组，我有兴趣只将它的一部分发送到 1 级。

最佳答案

您将数组 Foo3D 定义为 int[nx][ny][nz] 。因为C/C++是row-major语言，所以用Foo3D[0][j][k]表示的网格面的元素是，实际上是内存中连续的。



所以你可以简单地使用 i=0 发送人脸:

if (myrank == 0) {
    MPI_Send(Foo3D, ny*nz, MPI_INT, 1, 100, MPI_COMM_WORLD);
}
else if (myrank == 1){
    MPI_Recv(Foo3D, ny*nz, MPI_INT, 0, 100, MPI_COMM_WORLD, &status);
}

另一方面 ，如果您想使用缓冲区( Zero-Copy )发送 非连续 数据 而没有 ，您可以创建一个自定义 MPI 数据类型来表示要复制的数据，并直接从源发送缓冲区，并且 MPI 将读取您指定的数据，即使它在内存中是不连续的。这可以使用 MPI_Type_vector 来完成。

例如，如果要发送值 where k=0 ，即网格面Foo[i][j][0] 。



首先，创建表示要发送的网格面的数据类型。

// Create a data type and save its size
MPI_Datatype cubeface;
int cubefacesize;
MPI_Type_vector(nx*ny, 1, nz, MPI_INT, &cubeface);
MPI_Type_commit(&cubeface);
MPI_Type_size(cubeface, &cubefacesize);

然后，您可以使用以下方式发送和接收:

if (myrank == 0) {
    MPI_Send(Foo3D, 1, cubeface, 1, cubefacesize, MPI_COMM_WORLD);
} else if (myrank == 1) {
    MPI_Recv(Foo3D, 1, cubeface, 0, cubefacesize, MPI_COMM_WORLD, &status);
}

关于c++ - 如何使用 MPI 发送 3D 数组的切片？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/57564875/