r - 加快ddply

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我有这样的data.frame:

n  = 50
df = data.frame(group=sample(1:as.integer(n/2),n,replace=T),
                x = runif(n),
                y = runif(n),
                z = runif(n))
df = df[with(df,order(group)),]

对于group的每个唯一值,我需要做的是产生段,即产生新列的xendyendzend,这是该组中上一点的xyz值。对于组中的最后一个值,将端点作为组中的第一点。

我可以通过以下方式做到这一点:
res = ddply(df,"group",function(d){
  ixc  = c("x","y","z")
  dfE  = d[,ixc]
  dfE  = rbind(dfE[nrow(dfE),],dfE[1:(nrow(dfE)-1),])
  colnames(dfE) = paste0(ixc,"end")
  cbind(d,dfE)
})
print(head(res))

n很小时,这是微不足道的,但是,当n变得很大时,执行上述操作的时间变得很长,是否有更快的方法可以执行此操作,也许使用data.table

最佳答案

您可以使用shift包中的data.table函数来完成此操作。 xend的示例:

library(data.table)
setDT(df)[, xend := shift(x, 1L, fill = x[.N], type = "lag"), by = group]

对于所有列:
setDT(df)[, c("xend","yend","zend") := .(shift(x, 1L, fill = x[.N], type = "lag"),
                                         shift(y, 1L, fill = y[.N], type = "lag"),
                                         shift(z, 1L, fill = z[.N], type = "lag")),
          by = group]

这给您:
> head(df)
   group          x         y          z       xend      yend       zend
1:     1 0.56725304 0.7539735 0.20542455 0.71538606 0.3864990 0.01586889
2:     1 0.64251519 0.1255183 0.93371528 0.56725304 0.7539735 0.20542455
3:     1 0.14182485 0.7351444 0.89199415 0.64251519 0.1255183 0.93371528
4:     1 0.06613097 0.7625182 0.92669617 0.14182485 0.7351444 0.89199415
5:     1 0.71538606 0.3864990 0.01586889 0.06613097 0.7625182 0.92669617
6:     4 0.27188921 0.5496977 0.09282217 0.27188921 0.5496977 0.09282217

@akrun在评论中建议的另一种方法:
setDT(df)[, c("xend","yend","zend") := lapply(.SD, function(x) shift(x, fill = x[.N]))
          , by = group]

尽管此方法需要较少的键入操作,并且在包含变量方面提供了更大的灵活性,但它的运行速度也相当慢。

在问题中,您说:



但是,根据您所描述的期望行为,对于组中的最后一个值,将使用该组中的上一个值。我以为你的意思是:



使用的数据:
set.seed(1)
n  = 1e5
df = data.frame(group=sample(1:as.integer(n/2),n,replace=T),
                x = runif(n),
                y = runif(n),
                z = runif(n))
df = df[with(df,order(group)),]

关于r - 加快ddply,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/31891424/

10-12 18:57
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