我目前正在处理一个问题。我正在为一些特定的发行版开发一个程序包,除其他外,我想创建一个适合某些数据的混合函数。为此,我想使用例如fitdistr
函数。问题是我不知道混合物将由什么分布,重量和组分数组成。因此,我需要一个可以动态创建某些指定混合物的密度函数的函数,以便fitdistr
函数可以使用它。例如,如果用户将呼叫:
fitmix(data,dist=c(norm,chisq),params=list(c(mean=0,sd=3),df=2),wights=c(0.5,0.5))
要使用ML方法,代码需要创建一个密度函数
function(x,mean,sd,df) 0.5*dnorm(x,mean,sd)+0.5*dchisq(x,df)
因此它可以调用
optim
或fitdistr
。一个明显的解决方案是使用很多
paste
+ eval
+ parse
,但是我认为这不是最优雅的解决方案。一个不错的解决方案可能是隐藏在非标准的评估和表达式操作中,但是我在解决这一问题上没有足够的技能。附言参数可以用作优化器的初始值。
最佳答案
在R中使用as.call
和bquote
之类的函数来构建表达式相对简单,而函数是R中的第一类对象这一事实。使用动态签名来构建函数有些棘手。这是某些功能的通行证,可能会有所帮助
to_params <- function(l) {
z <- as.list(l)
setNames(lapply(names(z), function(x) bquote(args[[.(x)]])), names(z))
}
add_exprs <- function(...) {
x <- list(...)
Reduce(function(a,b) bquote(.(a) + .(b)), x)
}
get_densities <- function(f) {
lapply(paste0("d", f), as.name)
}
weight_expr <- function(w, e) {
bquote(.(w) * .(e))
}
add_params <- function(x, p) {
as.call(c(as.list(x), p))
}
call_with_x <- function(fn) {
as.call(list(fn, quote(x)))
}
fitmix <- function(data, dist, params, weights) {
fb <- Reduce( add_exprs, Map(function(d, p, w) {
weight_expr(w, add_params(call_with_x(d), to_params(p)))
}, get_densities(dist), params, weights))
f <- function(x, args) {}
body(f) <- fb
f
}
请注意,我更改了某些参数的类型。分布应该是字符串。参数应该是命名向量的列表。这样可以与这样的电话一起使用
ff <- fitmix(data, dist=c("norm","chisq"), params=list(c(mean=0,sd=3),c(df=2)),
weights=c(0.5,0.5))
它返回一个带
x
和命名参数列表的函数。你可以这样称呼它ff(0, list(mean=3, sd=2, df=2))
# [1] 0.2823794
返回的值与
x <- 0
0.5 * dnorm(x, mean = 3, sd = 2) + 0.5 * dchisq(x, df = 2)
# [1] 0.2823794