我希望能够轻松地更改通过脚本提交给nodesppnqsub等数量。也就是说,我想做这样的事情:

qsub script.sh --name=test_job --nodes=2 --ppn=2 --arg1=2

脚本如下:
#/bin/bash
#PBS -N ${NAME}
#PBS -l nodes=${NODES}:ppn=${PPN},walltime=${WALLTIME}
#PBS -q ${QUEUE}
#PBS -m ${MAILOPTS}
#PBS -M ${EMAIL}

/some/command ${ARG1}

因此,我希望能够传入参数,这些参数既可以更改PBS环境,也可以将一些参数传递到可执行文件本身。
我试过使用-vqsub参数:
qsub script.sh -v NAME=test_job,NODES=16,PPN=16,ARG1=2

但提交的作业名为script.sh和1node,1ppn
有什么解决办法吗?

最佳答案

在Torque中,当在命令行上指定匹配的参数时,将重写所有#PBS参数。例如,如果脚本具有:
#PBS -l nodes=2
您可以提交:
qsub script.sh -l nodes=4
命令行将优先于脚本。这些文档有一个complete list的命令行参数。

07-26 09:34
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