我正在尝试对程序的输入文件使用进程替换,但是它不起作用。是否因为某些程序不允许用进程替换输入文件?
以下内容不起作用:
bash -c "cat meaningless_name"
>sequence1
gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
>sequence2
gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Less verbose output, finishing with:
No sequences in file. No alignment!
但是以下控件确实起作用:
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Verbose output, finishing with:
CLUSTAL-Alignment file created [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
(No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Verbose output, finishing with:
CLUSTAL-Alignment file created [output_alignment.aln]
这表明进程替换本身可以工作,但是clustalw程序本身不喜欢进程替换-可能是因为它创建了非标准文件,或者创建了具有异常文件名的文件。
程序不接受进程替换是否很常见?我将如何检查这是否是问题所在?
我正在Ubuntu 9.10上运行GNU bash版本4.0.33(1)-发行版(x86_64-pc-linux-gnu)。 Clustalw是版本2.0.10。
最佳答案
是的。我在其他程序中也注意到了同样的事情。例如,它在emacs中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。对我来说,绝对是一个特殊的文件/proc/self/fd/some_number
。而且,使用默认设置在less
和most
中均无法可靠地工作。
对于大多数:
most <(/bin/echo 'abcdef')
而较短的则什么也不显示。较长的值将截断开头。
less
显然有效,但仅当您指定-f
时才有效。在实践中,我发现zsh的
=
更加有用。在语法上相同,除了=
而不是<
。但是它只是创建一个临时文件,因此支持与程序无关。编辑:
我发现zsh使用
TMPPREFIX
选择临时文件名。因此,即使您不希望真正的/tmp
为 tmpfs
,也可以为zsh挂载一个。关于bash - 某些程序不接受输入文件的进程替换吗?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/4274171/