我有两个看起来像这样的文件:

文件1:

RYR2 29 70  0.376583106063  4.77084855376
MUC16 51 94 0.481067457376  3.9233164551
DCAF4L2 0 13    0.0691414496833 3.05307268261
USH2A 32 62 0.481792717087  2.81864194236
ZFHX4 14 37 0.371576262084  2.81030548752


文件2:

A26B2
RYR2
MUC16
ACTL9


我需要根据第一列进行比较,并仅打印第一文件中不在第二行中的那些行,因此输出应为:

DCAF4L2 0 13    0.0691414496833 3.05307268261
USH2A 32 62 0.481792717087  2.81864194236
ZFHX4 14 37 0.371576262084  2.81030548752


我尝试了grep:

 grep -vFxf file2 file1


与awk:

awk 'NR==FNR {exclude[$0];next} !($0 in exclude)' file 2 file1


通讯:

comm -23 <(sort file1) <(sort file2)


什么都行不通

最佳答案

您可以使用

grep -vFf file2 file1


同样,grep -vf file2 file1也将起作用,但是如果file2字符串包含应以文字字符形式读取的*[,则可能会遇到麻烦,因为应将其转义。 F使grep将那些字符串视为固定字符串。

笔记


-v:反转匹配。
-f file:从文件中获取正则表达式。
-F:将模式解释为固定字符串列表(而不是正则表达式),并用换行符分隔,其中任何一个都将被匹配。


因此,它从file2读取正则表达式并将其应用于file1,一旦找到匹配项,由于反向搜索,该行将不会输出。这足够了,因为仅第一列包含字母数字,其余仅包含数字数据。

为什么您的命令不起作用

-x--line-regexp的缩写)表示Select only those matches that exactly match the whole line

另外,请参阅有关grep options in grep documentation的更多信息。

关于awk - 根据第一列比较两个文件,打印一个文件的唯一部分,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/50049271/

10-11 23:09
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