我想使用Keras中的有状态LSTM开发用于二进制分类的时间序列方法

这是我的数据。我有很多录音,例如N。每个记录包含22个时间长度为M_i(i=1,...N)的时间序列。我想在Keras中使用有状态模型,但是我不知道如何重塑数据,尤其是关于如何定义batch_size的情况。

这是我进行stateless LSTM的方法。我为所有记录创建了长度为look_back的序列,以便获得大小为(N*(M_i-look_back), look_back, 22=n_features)的数据

这是我用于此目的的功能:

def create_dataset(feat,targ, look_back=1):
    dataX, dataY = [], []
#     print (len(targ)-look_back-1)
    for i in range(len(targ)-look_back):
        a = feat[i:(i+look_back), :]
        dataX.append(a)
        dataY.append(targ[i + look_back-1])
    return np.array(dataX), np.array(dataY)


其中,feat是大小为(n_samples, n_features)的二维数据数组(对于每个记录),而targ是目标矢量。

因此,我的问题是,根据上述数据,如何为有状态模型重塑数据并考虑批处理概念?是否要采取预防措施?

我想做的是能够将每个记录的每个time_step分类为癫痫发作/非癫痫发作。

编辑:我想到的另一个问题是:我的录音包含不同长度的序列。我的状态模型可以学习每个记录的长期依赖关系,因此这意味着batch_size在一个记录与另一个记录之间是不同的...如何处理?在完全不同的序列(test_set)上进行测试时,会不会引起泛化麻烦?

谢谢

最佳答案

我认为您不需要为您的目的使用有状态层。

如果您想长期学习,请不要创建这些滑动窗口。数据的形状为:

(number_of_independent_sequences, length_or_steps_of_a_sequence, variables_or_features_per_step)


我不确定您的问题中的措词是否正确。如果“录音”就像“电影”或“歌曲”,“语音剪辑”或类似的东西,则:


序列数=录音数


按照“录制”的想法,时间步长将是“视频中的帧”或音频文件中的“样本”(时间x 1通道的sample_rate)。 (请注意,喀拉拉语中的“样本”是“序列/记录”,而音频处理中的“样本”是喀拉斯语中的“步骤”)。


time_steps =帧数或音频样本


最后,特征/变量的数量。在电影中,就好像是RGB通道(3个功能),音频一样,还是通道数(2个立体声)。在其他类型的数据中,它们可能是温度,压力等。


特征=每个步骤中测得的变量数


具有这种形状的数据将对有状态= True和False都起作用。

这两种训练方法是等效的:

#with stateful=False
model.fit(X, Y, batch_size=batch_size)

#with stateful=True
for start in range(0, len(X), batch_size):
    model.train_on_batch(X[start:start+batch_size], Y[start:start+batch_size])
    model.reset_states()


可能仅在更新优化器的方式上有变化。

对于您的情况,如果您可以创建上述形状的输入数据,并且不打算递归预测未来,那么我看不出使用stateful=True的理由。

分类每一步

为了对每个步骤进行分类,您无需创建滑动窗口,也不必使用stateful=True

循环图层可以通过设置return_sequences=True来输出所有时间步长。

如果输入的形状为(batch, steps, features),则将需要目标的形状为(batch, steps, 1),这是每个步骤的一个类。

简而言之,您需要:


具有return_sequences=True的LSTM层
形状为X_train(files, total_eeg_length, 22)
形状为Y_train(files, total_eeg_length, 1)


提示:由于LSTM永远不会很好地分类开头,因此您可以尝试使用Bidirectional(LSTM(....))层。

输入长度不同

要使用不同长度的输入,需要设置input_shape=(None, features)。考虑我们在聊天室features = 22中的讨论。

然后,您可以:


分别加载每个EEG:


X_train作为(1, eeg_length, 22)
Y_train作为(1, eeg_length, 1)
model.train_on_batch(array, targets)分别训练每个EEG。
您将需要手动管理时期,并将test_on_batch用于验证数据。

用零或另一个虚拟值填充较短的EEG,直到它们全部达到max_eeg_length并使用:


模型开头的Masking层将丢弃带有虚拟值的步骤。
X_train作为(eegs, max_eeg_length, 22)
Y_train作为(eegs, max_eeg_length, 1)
您可以使用常规model.fit(X_train, Y_train,...)进行训练

关于python - 如何为Keras中的有状态LSTM准备数据?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/52071751/

10-12 21:53
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