请考虑以下情况：
我每小时（每次）测量一次值（从几个月到~10年的活动）
几个物种（1到10）
带多个仪器（1至5）
在几个测量点（~70）
每个站点都有几个采样级别（1到5）
每个值都有一个标志，指示它是否有效
考虑到数据库/文件/任何东西都应该用r可读写，我正在寻找存储这些数据的最快和最简单的方法。
注意：
一些实验包括长时间测量少数物种，单一仪器和采样水平，
一些实验包括对许多站点（大约70个站点）的几个月时间进行比较。
一些站点有许多采样级别和/或仪器（将进行比较）
存储系统必须是并行的可读（如果可能的话是可写的）
我到目前为止所做的：
mysql数据库，每个站点/物种有一个表，每个表包含以下列：时间、采样级别、仪器、值和标志。当然，随着网站数量的不断增长，表的数量也在不断增长。比较网站是痛苦的，因为它需要很多请求。而且，采样水平和仪器在表内重复了很多次，这种效率低下占用了空间。
netcdf文件：有趣的是它们存储多维数据的能力，它们很好地存储了一组数据，但不适合用于日常修改，也不太“可伸缩”。
druid是一个多维数据库管理系统，最初是面向“商业智能”的。这个原则是好的，但对我的申请来说太重太慢了。
因此，我正在寻找一个系统：
差不多要花同样的时间来检索
1个地点、1个物种、1个仪器、1个采样水平的100小时数据，或
10个地点、1个物种、1个仪器、1个采样水平的10小时数据，或
1个地点、2个物种、1个仪器、5个采样水平的10小时数据，或
等。
允许并行R/W
最小化从数据库中写入和读取的时间
最小化已用磁盘空间
允许轻松添加新站点、仪器或种类等。
与R一起工作
一个好的系统应该是一种超立方体，它允许所有维度上的复杂请求…
最佳答案
具有多列主键（或候选键）的关系数据库非常适合存储这种多维数据。根据您的描述，合适的主键应该是time、species、instrument、site、sampling_level和flag。似乎是值的属性，而不是键。此表应包含用于选择要检索的数据的所有列的索引。您可能需要其他表来存储物种、仪器和站点的描述或其他属性。主数据表中的每个表都有外键。
关于r - 如何存储多维数据，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/46191897/